在浸泡过程中，浸泡水不是从玉米颗粒的表皮各部分渗透到内部**，而是从颗粒底部根幅处的疏松**进入颗粒，通过麸皮底层的多孔性**渗透到颗粒内部，玉米淀粉加工，所以必须保证足够的浸泡时间。玉米在50℃浸泡4小时后，胚芽部分吸收水分达到值，8小时后，胚体部分也吸收水分达值。这个时候玉米颗粒变软，经过粗碎，胚芽和麸皮可以分离开。但蛋白质网尚未被分散和*坏，淀粉颗粒还不能游离出来。若继续浸泡，能使蛋白质网分散。浸泡约24小时后，软胚体的蛋白质网基本上分散，约36小时后，硬胚体的蛋白质网也分散。因为蛋白质网的分散过程是先膨胀，玉米淀粉，后转变成细小的球形蛋白质颗粒，后网状***坏。所以要使蛋白质网完全分散，需要48小时以上的浸泡时间。
变性淀粉是利用物理、化学和酶等手段改变天然淀粉的性质，使其符合各行各业应用的需要。变性淀粉的使用量和范围非常广，中国已经生产出了预糊化淀粉、酸化淀粉、氧化淀粉、醚化淀粉、酯化淀粉、交联淀粉、接枝淀粉等应用到纺织、造纸、食品、石油、、建筑、农业饲料、日用化工等行业共70多个品种。其中以造纸行业的应用量为，约占总量50-60%，主要用作湿部添加剂、层间或表面喷雾剂、表面施胶剂和涂布粘合剂。它们显著提高纸张的各种物理强度，提高质量和档次，降低木浆配比，提高细小纤维、填料的留着率，提高成品纸的灰分、白度和不透明度，减少湿部断头，减轻三废排放，玉米淀粉厂，并改善印刷性能。
在浸泡水中溶加浸泡剂经试用的结果表明，石灰水、和亚都不及效果好，的含量不宜太高。因为含的浸泡水对蛋白质网的分散作用是随着含量增加而增强。当浓度为0.2%时，蛋白质网分散作用适当，淀粉较易分离；而浓度在0.1%时，不能发生足够的分散作用，淀粉分离困难。一般不超过0.4%，因为的浓度过高，酸性过大，对玉米浸泡并没有多大好处，相反地会**乳酸发酵和降低淀粉粘度。
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