堆制方法，按原料的不同，分高温堆肥和普通堆肥。高温堆肥以纤维含量较高的植物物质为主要原料，在通气条件下堆制发酵，产生大量热量，堆内温度高（50～60℃），因而腐熟快，堆制快，养分含量高。高温发酵过程中能杀其中的病菌、虫卵和杂草种子。普通堆肥一般掺入较多泥土，发酵温度低，腐熟过程慢，堆制时间长。堆制中使养分化学组成改变，精致有机肥代理，碳氮比值降低，能被植物直接吸收的矿质营养成分增多，并形成腐殖质。
中量元素肥料的生产在很长时间里，都不为人们所重视。原因是在一些常用的肥料品种中，特别是低浓度肥料品种中同时含有钙、镁或硫元素，大气中的SO2通过雨水进入土壤，也是硫元素的来源之一。近30多年来，化肥品种结构中高浓度肥料逐步代替了低浓度肥料，使带入土壤中的钙、镁和硫元素减少，一些土壤出现了短缺中量营养元素，特别是短缺硫元素的现象，精致有机肥价格，从而使中量元素肥料的生产和使用得到重视。含钙、镁肥料石灰石粉、白云石粉、熟石灰、贝壳粉和其他含钙、镁的工业废料，广泛用作土壤调理剂和提供钙、镁营养元素。其土壤调理作用是：①改善土壤中磷肥的有效性。在含铁、铝氧化物高的土壤中，由于磷酸盐与铁、铝化合物的反应，磷肥的有效性降低。施用钙、镁调理剂使土壤pH保持在6～7，可以阻缓上述反应进行。②有利于土壤中铵态氮转化为硝态氮的反应，多数硝化菌需要钙素。③促进生物固氮的过程。④调整作物对微量元素的吸收量，土壤pH保持在6～7时，精致有机肥，微量营养元素对作物保持一定的有效性。⑤改良土壤的物理性质，主要是改善土壤的粒度分布
单施有机肥3500～7000公斤，9年后土壤有机碳提高0.04%～0.16%，容重降低0.04～0.06克/厘米3，总孔隙度提高1.5%～2.3%，毛管孔隙度提高3.45%～4.05%，田间持水量提高1.13%～1.31%。配合施用氮9.2～18.4公斤的尿素后，上述各项指标比单施有机肥处理明显提高。有机碳比对照提高0.09%～0.19%，精致有机肥生产，容重降低0.03～0.1克/厘米3，总孔隙度提高1.1%～3.8%，毛管孔隙度提高3.45%～5.0%，田间持水量提高2.49%～4.24%。
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