大气尘是无菌室要直接处理的对象，在洁净技术中尤为常用的是以≥0.5μm的微粒数量为准的计数浓度，以至干净的同温层(距地表10km)来说，这样的微粒约有20粒/，很干净的海面上空约有2600粒/L。陆地上计数浓度差别极大，同一地区不同时间差别也很大，我国大气计数浓度可粗分为“工业城市”、“城市郊外”、“非工业区或农村”，生物制药装修，其≥0.5μm的微粒浓度分别为1*106粒/L，生物制药装修厂家，2*105粒/L，和3*105粒/L。
无菌室内部应六面光滑、平整、无缝隙、不起灰、不落尘、耐腐蚀、易清洗、无死角，室内不得安装上、下水道。进入无菌操作间应有人净和物净的设施。无菌操作间应根据检验品种的需要，保持对邻室的相对正压或相对负压。室内应设专用传递窗，所有实验器材消毒灭菌处理后，通过传递窗进入无菌间或在进口通道内灭菌处理后送入无菌间。
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