1、养分
由于原材料本身养分低或发酵生产工艺原因，有些企业的有机肥发酵出来，其养分并不合格，加上有些厂连化验室都没有，一批产品就这样迈向了市场。
2、***
***会在植物中积累，通过食物链集中到人身上，对人造成伤害，同时***也会对农作物的生长造成损害。由于设备昂贵，大部分企业是没有设备对***进行检测的。
3、***微生物
堆肥温度在50℃以上的时间不少于5天，可以病原菌及虫卵，达到无害化。但实际上很多厂家有机肥生产过程中，由于工艺水平原因，未能达50℃以上或达到了却时间维持过短，大部分蛔虫卵、大肠菌群等未能大部分杀灭，七台河水溶肥，影响了作物健康生长。
生物有机肥它符合生产、无公害绿色农产品的肥料原则要求。在施用生物有机肥时掌握正确的方法才能达到好的效果。
开始、生物有机肥施入土层不易过深。因为生物有机肥是依靠其活性来分解有机质的，其活性在一定的温度、湿度、透气性、有机物质的条件下才能实现。而施入太深会影响生物肥活性。
其次、生物有机肥施用时也不宜与单一化肥混施。单一化肥因其成分单一，水溶肥代加工，且酸碱程度不同，如果大量施用，势必影响生物有机肥的生物活性。因此，生物有机肥单独施用。
另外、生物有机肥穴施更重要，特别是茄果类蔬菜，重茬现象不可避免。即使补施了一些生物肥、微肥，由于受温度、湿度、透气性、有机质等条件的影响，再加上幼苗根弱的原因，很难快速发挥作用，如果穴施生物有机肥，一方面可快速促进活跃土壤，提高土壤透气性，灌装水溶肥，促进根系快速生长发育；另一方面可缓解因有机肥不腐熟、化肥没分解形成养分的空缺，及时供给根系养分，给根系一个良好的生长环境，促进团根早形成。
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