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泵用后不能及时清洗移动相中不得含有腐蚀性物质，含有缓冲液的流动相不能留在泵中，离子源消耗品批发，特别是当泵停泵过夜或更久时。若含有缓冲液的流动相留在泵中，可能会析出盐的微晶，如上述固体颗粒那样损坏密封环和柱塞，甚至只是因为溶液处于静止状态时，会析出。所以，必须用纯水将泵完全清洗干净，然后转换成适合于保存色谱柱和有利于泵维护的溶剂(对于反相键合硅胶固定相，可能是或-水)流相去空水泵工作时要注意防止溶剂瓶内的流动相被用完，否则泵运转也会磨损柱塞、气缸或密封环，终造成泄漏。如果没有流动相的外流，没有压力指示怎么办？也许是泵内有大量的气体，此时可开启泄压阀，使泵在较大流量(如5 ml/min)下运转，排出气泡，也可用一个50 ml的针筒在泵出口协助抽气。另外一个可能的原因是密封环磨损需要更换。
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不稳定的压力和流量其原因可能是需要排除的气泡；或单向阀内有异物，可卸下单向阀，浸入内超声清洗。有时候可以是砂滤棒内部出现气泡，或者被细小盐粒或滋生微生物部分堵塞，此时，可卸下砂滤棒浸入流动相超声除气泡，或将砂滤棒浸入稀酸(如4 mol/L)中迅速除去微生物，或将盐溶解，再立即清洗。为什么压力太大还是太低？也许是管道堵塞了，需要清理清理。另一种可能是由于管道出现了泄漏。检验阻塞或泄漏时，应逐段进行。采用梯度洗脱时，由于多种溶剂混和，组分不断变化，产生了一些特殊问题，必须引起足够的重视。PS:(在液相色谱中对成分复杂的样品，采用梯度洗脱法。在同一分析周期内，不停地改变流动相的浓度比例，称为梯度洗脱。这样，离子源消耗品供应商，在一个复杂样品中，性质差异较大的组分，就能达到各自合适的容量因子 k的分离效果。
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四极离子阱， QTrap从技术上讲，传统的 QQQ四极杆增加了辅助射频，可以做选择性激发；或者从功能上来说，给 QQQ提供了多级串级功能。优点：具有 MRM、 SRM、中性丢失和多级串级功能，非常适合未知样品的结构分析。劣势：或者是分辨率太低代表产品：ABI/Sciex，QTrap5500系列质谱：世界上灵敏的离子阱系统。线形离子阱， Linear Ion Trap增强版的3D离子阱好处：与传统的3D离子阱相比，灵敏度提高了10倍以上；多层系列质谱。劣势：与 QqQ相比， MRM或中性丢失等特征群筛选功能不能进行。代表产品：Thermo公司的 LTQ XL线性离子阱质谱仪：增强的二维线性离子阱质谱仪，具有的灵敏度和超快的循环时间，能保证在的时间内，以少的样本获得的质谱信息。
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线性与三维离子阱的比较研究这一对比也许是见的一幕-线型离子阱的灵敏度、分辨力、速度、通量等指标都优于传统的3D离子阱。线型离子阱市场严重蚕食了3D离子阱市场，尤其是在中国质谱市场，由于用户爱追新潮、求大求好，线型离子阱在中国市场上非常受欢迎。但事实上，线型离子阱在国外并不流行，尤其是一些老用户，因为习惯了离子阱的指标，对于价格高的线型离子阱并不太流行，尤其是一些离子阱老用户，对于价格高的线型离子阱来说，价格高的线型离子阱就不太流行了。四极杆飞行时间串联质谱， QTOFQMS采用 QMS作为质量过滤器， TOFMS作为质量分析工具。
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进样器的维护给样机可分为手动和自动两种，尽管它们的工作方式不同，但其使用要点基本相同。自动进样器常见的问题是交叉污染，造成交叉污染的原因非常直接，样品在进样针的内外表面都残留着样品，离子源消耗品南区总代理，然后再进入色谱系统。要解决交叉污染，主要靠清洁。2、操作精细，手动进样器的操作要领大致相同，应使用液相色谱 LC进样针，进样时要插到针头，不使用时要将针头留在进样器内，在使用前后要及时清洗。
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色谱柱维护化合物分离的关键是色谱柱。维护好的色谱柱具有很高的塔板数量，仪器基线稳定。1、避免压力、温度急剧变化和机械振动。气温骤降或使色谱柱从高处落下，都会影响柱内填充状态；柱压突然升高或降低，也会对柱内填充物产生冲力，所以在调节流速时要缓慢进行，在阀进样时阀的转动不能过缓(如前面所述)。2、溶剂的组成应逐渐改变，尤其是反相色谱，不能直接由改为全水，反之亦然。3、色谱柱反冲，纳谱分析小分子分离液相色谱柱 ChromCore系列和 EcoPak系列色谱柱进行反冲；纳谱分析的手性色谱柱 UniChiral系列色谱柱可以反冲、反冲去除留在柱头的杂质。而纳谱分析生物大分子液相色谱柱 BioCore系列色谱柱不能反冲，否则反冲会迅速降低柱效。4、为避免破坏固定相，选择合适的流动相(特别是 pH)。有时候，揭阳离子源消耗品，一预柱可以在进样器前连接，分析柱是硅胶粘合时，预柱为硅胶，可使流动相在进入分析柱前先被硅胶“饱和”，避免分析柱中的硅胶基质溶解。
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