真核细胞同源重组法
1994 年，Graham F建立了在293细胞同源重组产生重组腺病毒的方法。这个方法需要2个质粒：骨架质粒含有腺病毒绝大部分***组序列，但不含有包装信号；穿梭质粒含有ITR、包装信号和目的***克1隆位点，以及两段与骨架质粒有重叠的序列。将目的***克1隆到穿梭质粒，与骨架质粒共转染293细胞，由于这两个质粒的部分序列有重叠，能够在细胞内发生同源重组，腺病毒载体，***终产生完整的载体***组，并包装出重组病毒颗粒。该方法曾经被广泛使用，推动了腺病毒载体的发展。由于细胞内重组效率低，某些重组事件还可能产生可copy病毒(RCV)，必需经过噬斑纯化才能获得正确的克1隆化的重组病毒，费时费力，正逐渐被其他方法替代。
农bacillus转化法
农bacillus包括引起植物冠瘿瘤的根***农bacillus和引起发根病的发根农杆1菌。根***农杆1菌和发根农bacillus有相似的遗传背景。在农bacillus介导的转化中，80%左右是由根***农bacillus介导的，大约20%是由发根农bacillus介导的。这里主要介绍根***农杆1菌介导的转化。
根***农bacillusTi质粒上有一段转移DNA（T-DNA）和Vir区，在农bacillus侵染植物时，这段T-DNA可以插入到植物***组中，使其携带的***在植物中得以表达。Vir区共24个***，它们表达的蛋白与T-DNA的加工和转移有关。
腺病毒是无包膜的线性双链DNA病毒，在自然界分布广泛，至少存在100种以上的血1清型。其***组长约36kb，两端各有一个反向末端重复区（ITR），ITR内侧为病毒包装信号。***组上分布着4个早期转录元（E1、E2、E3、E4）承担调节功能，以及一个晚期转录元负责结构蛋白的编码。早期***E2产物是晚期***表达的反式因子和copy必须因子，早期***E1A、E1B产物还为E2等早期***表达所必须。因此，E1区的缺失可造成病毒在copy阶段的流1产。E3为copy非必须区，其缺失则可以大大地扩大插入容量。腺病毒载体大多以5型（Ad5）、2型（Ad2）为基础，新增了55型（Ad55），很多研究机构在研究当中，55型将比5型流行以及应用更具广泛性。
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