关注冷却系统。大型空压机运行冷却系统有风冷和水冷两种。对大型空压机而言，更多的是采用水冷的方式进行冷却。水冷系统一定要加强水质的净化，避免水中的钙镁等离子因高温在冷却器中结成水垢，影响冷却器传热效果。如果使用冷却水塔循环系统，则需定期在水中加软化剂和定期清理冷却水塔，维持水的清洁。同时，冷却水塔需符合空压机冷却所需的冷却水量，抽水泵功率数也一定要选择正确。
空压机基本要求：效率要高。空压机寄生功率，螺杆式风冷空压机，严重影响电堆效率。小型化和低成本。由于功率密度和成本限制，小型化和低成本有利于产业化。低噪音。空压机噪音是燃料电池发动机主要噪音来源。特性范围宽。满足环境温度、海拔高度变化需求，空压机需要有更宽的MAP特性。动态响应快。车用动力系统会从“氢电锂电混合”走向氢电全功率驱动。
更换油分芯。油气分离芯的性能直接影响压缩空气运行电流的大小，所以使用一段时间后就要更换。大型空压机油气分离器芯位于油气分离罐内，每运行4000小时更换一次，或者只要压差发讯器报警（压差大于0.1MPa）时应及时更换。更换油分芯的时候一定要注意，一方面，安装抽油管时，必须保证该管插入油气分离芯的底部，以保证底部残油完全被抽出。
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