发酵饲料应用十分广泛, 发酵根据获得产品的不同可分为微生物酶发酵、微生物菌体发酵、微生物代谢产物发酵、微生物的转化发酵、生物工程细胞的发酵。根据微生物的种类不同可分为厌氧发酵和好氧发酵。根据培养基的不同可分为固体发酵饲料和液体发酵饲料 (FLF) 。根据设备分为敞口发酵、密闭发酵、浅盘发酵和深层发酵。
常见的发酵饲料主要包括木薯渣、秸秆加工饲料、棉菜茶粽饼粕 (如棕榈粕、豆粕、棉粕、菜籽粕、油茶籽饼、蓖麻饼等) 、动物下脚料、潲水发酵饲料、菌糠加工饲料、粉渣醋渣酱渣发酵饲料、果渣、酒糟、青贮饲料、生物蛋白与肽、米糠统糠等方面。
我国微生物资源丰富, 用于发酵工业的微生物主要包括***、酵母菌和霉菌等。2010年公告发布的《食品添加剂品种目录》征求意见稿中规定, 可直接饲喂动物的饲料级微生物添加剂在2008年的基础上, 增删了部分和酶制剂品种。具体如下:地衣芽孢、枯草芽孢、两歧双歧、粪肠球菌、屎肠球菌、乳酸肠球菌、嗜酸乳、干酪乳、乳酸乳、植物乳、乳酸片球菌、戊糖片球菌、产朊假丝酵母、酿酒酵母、沼泽红假单胞菌;2010新增:***双歧、长双歧、短双歧、动物双歧、青春双歧、嗜热链球菌、罗伊氏乳、动物双歧、黑曲霉、米曲霉、迟缓芽孢、短小芽孢、纤维二糖乳、发酵乳、保加利亚乳、产丙酸丙酯、发酵乳、保加利亚乳、产丙酸丙酯、布氏乳、副干酪乳、凝结芽孢、侧孢芽孢等。市场上用于饲料发酵的益生类主要是乳酸菌、芽孢、酵母和霉菌。
3、小苏打的添加：小苏打不能改善消化，尤其在有高量微矿添加的情况下，使腹泻增加，造成吸收障碍，可以看到异形蛋的增加，尤其一种侧面有塌陷的蛋。
4、植酸酶的使用：在高锰、高钙的情况下，植酸酶的使用更容易形成硬壳的蛋，敲打时蛋壳出现横向裂纹，而非正常的性状裂纹，这种蛋的孵化率是比较低的，大约会导致3～5%的鸡雏不能出壳，出壳后的鸡雏腿病的问题也较为明确;种鸡和蛋鸡对于植酸酶的使用应有不同的使用价值，种鸡用于生产鸡苗，与普通鸡蛋有明确的不同，不应在种鸡料中添加使用植酸酶。