我国微生物资源丰富, 用于发酵工业的微生物主要包括***、酵母菌和霉菌等。2010年公告发布的《食品添加剂品种目录》征求意见稿中规定, 可直接饲喂动物的饲料级微生物添加剂在2008年的基础上, 增删了部分和酶制剂品种。具体如下:地衣芽孢、枯草芽孢、两歧双歧、粪肠球菌、屎肠球菌、乳酸肠球菌、嗜酸乳、干酪乳、乳酸乳、植物乳、乳酸片球菌、戊糖片球菌、产朊假丝酵母、酿酒酵母、沼泽红假单胞菌;2010新增:***双歧、长双歧、短双歧、动物双歧、青春双歧、嗜热链球菌、罗伊氏乳、动物双歧、黑曲霉、米曲霉、迟缓芽孢、短小芽孢、纤维二糖乳、发酵乳、保加利亚乳、产丙酸丙酯、发酵乳、保加利亚乳、产丙酸丙酯、布氏乳、副干酪乳、凝结芽孢、侧孢芽孢等。市场上用于饲料发酵的益生类主要是乳酸菌、芽孢、酵母和霉菌。
微生物发酵能分泌产生多种蛋白酶类有效降解饲料原料抗营养因子（球蛋白、β-伴球蛋白、水苏糖和棉籽糖）等，从而提高饲料营养价值。如发酵豆粕能完全去除豆粕中的抗原蛋白和不良寡糖等抗营养因子。
产生风味物质，提高饲料适口性、动物采食量：微生物发酵产生多种的风味物质，具有发酵香味，因此生物发酵料能增强饲料的诱食性，提高饲料适口性和动物采食量。
3.获得功能型饲料产品。发酵获得有特定功能或者目标产物的产品，如酵母培养物，乳酸菌培养物，发酵纤维饲料，发酵***饲料等。
4.扩大饲料范围。非常规饲料发酵转化：农副产品加工副产物、淀粉类加工副产物、玉米淀粉加工副产物、土豆淀粉加工副产物、大米糖加工副产物、食品酿造加工副产物等等。
5.发酵可以提高动物产品品质，发酵饲料的应用比例增加，可以明显改善肉蛋奶的风味。
