微生物发酵能分泌产生多种蛋白酶类有效降解饲料原料抗营养因子（球蛋白、β-伴球蛋白、水苏糖和棉籽糖）等，从而提高饲料营养价值。如发酵豆粕能完全去除豆粕中的抗原蛋白和不良寡糖等抗营养因子。
产生风味物质，提高饲料适口性、动物采食量：微生物发酵产生多种的风味物质，具有发酵香味，因此生物发酵料能增强饲料的诱食性，提高饲料适口性和动物采食量。
3、小苏打的添加：小苏打不能改善消化，尤其在有高量微矿添加的情况下，使腹泻增加，造成吸收障碍，可以看到异形蛋的增加，尤其一种侧面有塌陷的蛋。
4、植酸酶的使用：在高锰、高钙的情况下，植酸酶的使用更容易形成硬壳的蛋，敲打时蛋壳出现横向裂纹，而非正常的性状裂纹，这种蛋的孵化率是比较低的，大约会导致3～5%的鸡雏不能出壳，出壳后的鸡雏腿病的问题也较为明确;种鸡和蛋鸡对于植酸酶的使用应有不同的使用价值，种鸡用于生产鸡苗，与普通鸡蛋有明确的不同，不应在种鸡料中添加使用植酸酶。
3.获得功能型饲料产品。发酵获得有特定功能或者目标产物的产品，如酵母培养物，乳酸菌培养物，发酵纤维饲料，发酵***饲料等。
4.扩大饲料范围。非常规饲料发酵转化：农副产品加工副产物、淀粉类加工副产物、玉米淀粉加工副产物、土豆淀粉加工副产物、大米糖加工副产物、食品酿造加工副产物等等。
5.发酵可以提高动物产品品质，发酵饲料的应用比例增加，可以明显改善肉蛋奶的风味。