微生物发酵能分泌产生多种蛋白酶类有效降解饲料原料抗营养因子（球蛋白、β-伴球蛋白、水苏糖和棉籽糖）等，从而提高饲料营养价值。如发酵豆粕能完全去除豆粕中的抗原蛋白和不良寡糖等抗营养因子。
产生风味物质，提高饲料适口性、动物采食量：微生物发酵产生多种的风味物质，具有发酵香味，因此生物发酵料能增强饲料的诱食性，提高饲料适口性和动物采食量。
饲料在发酵过程中会产生以乳酸为主的多种有机酸，发酵后pH下降到4.0以下，从而***了中性、好氧******的生长环境，***大肠菌群、沙门氏菌等病原菌的生长。发酵饲料中的***素是由***产生的一种蛋白类物质，具有类作用。乳酸菌属产生的***素对链球菌、沙门氏菌、、假单胞菌和大肠有一定的***作用。
2.提高饲料营养物质的消化率及利用率
饲料经过发酵之后，进行了一系列的生***学反应，其中复杂的大分子有机物会在一定程度上降解，同时还会产生大量的营养丰富的微生物菌体蛋白及有用的代谢产物。饲料在发酵过程中，大分子蛋白质会逐渐转变为小分子肽和游离氨基酸。发酵饲料中植酸酶的含量显著增加，植酸酶活性提高。同时，发酵饲料中的植酸含量降低，总磷及有效磷含量显著增加。
3.降解饲料中的***物质和抗营养因子
发酵饲料中，某些乳酸可以***霉菌的生长和的形成。嗜酸乳酸、保加利亚乳酸和植物乳酸可***寄生曲霉的孢子萌发。另外，微生物的代谢产物也可以降低饲料中的含量。例如，发酵产生的甘露聚糖可以有效地降解等。经过发酵处理，可以有效地降低饲料中游离棉酚的含量，提高棉酚脱毒率；发酵饲料的抗原蛋白发生大幅度的降解，棉籽糖家族寡糖被降解，胰蛋白酶***因子、脲酶和植酸等抗营养因子也被微生物降解。
