维持动物肠道菌群平衡, 提高动物力：发酵饲料中存在的有益微生物在肠道内迅速繁殖, 相对于致病菌在数量上占据了优势, 形成了竞争性***作用, 大大***了病原菌的生长繁殖。同时有益菌的某些代谢产物 (如乳酸和) 使消化道p H降低, 在低p H环境下, 可以有效***潜在病原菌的滋长、繁殖, 从而维持或***肠道内微生物菌群平衡, 增强肠道的抗能力。
微生物发酵能分泌产生多种蛋白酶类有效降解饲料原料抗营养因子（球蛋白、β-伴球蛋白、水苏糖和棉籽糖）等，从而提高饲料营养价值。如发酵豆粕能完全去除豆粕中的抗原蛋白和不良寡糖等抗营养因子。
产生风味物质，提高饲料适口性、动物采食量：微生物发酵产生多种的风味物质，具有发酵香味，因此生物发酵料能增强饲料的诱食性，提高饲料适口性和动物采食量。
3.降解饲料中的***物质和抗营养因子
发酵饲料中，某些乳酸可以***霉菌的生长和的形成。嗜酸乳酸、保加利亚乳酸和植物乳酸可***寄生曲霉的孢子萌发。另外，微生物的代谢产物也可以降低饲料中的含量。例如，发酵产生的甘露聚糖可以有效地降解等。经过发酵处理，可以有效地降低饲料中游离棉酚的含量，提高棉酚脱毒率；发酵饲料的抗原蛋白发生大幅度的降解，棉籽糖家族寡糖被降解，胰蛋白酶***因子、脲酶和植酸等抗营养因子也被微生物降解。
