样品采集一般按三个阶段进行：前期采样：根据背景资料与现场考察结果，采集一定数量的样品分析测定，用于初步验证污染物空间分异性和判断土壤污染程度，为制定监测方案（选择布点方式和确定监测项目及样品数量）提供依据，土壤检测第三方机构，前期采样可与现场调查同时进行。系统随机将监测区域分成面积相等的几部分（网格划分），每网格内布设一采样点，这种布点称为系统随机布点。运输过程中严防样品的损失、混淆和沾污。对光敏感的样品应有避光外包装。
分析取用后的剩余样品一般保留半年， 预留样品一般保留2 年。特殊、珍稀、仲裁、有争议样品一般要保存。 样品保存按样品名称、编号和粒径分类保存。对于易分解或易挥发等不稳定组分的样品要采取低温保存的运输方法，并尽快送到实验室分析测试。分块随机根据收集的资料，如果监测区域内的土壤有明显的几种类型，则可将区域分成几块，每块内污染物较均匀，块间的差异较明显。
土壤环境监测是指通过对影响土壤环境质量因素的代表值的测定，确定环境质量（或污染程度）及其变化趋势。我们通常所说的土壤监测是指土壤环境监测，其一般包括布点采样、样品制备、分析方法、结果表征、资料统计和质量评价等技术内容。运输过程中严防样品的损失、混淆和沾污。对光敏感的样品应有避光外包装。样品保存按样品名称、编号和粒径分类保存。对于易分解或易挥发等不稳定组分的样品要采取低温保存的运输方法，并尽快送到实验室分析测试。
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