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有机污染物进入池内，经过搅拌与池内原有的厌氧活性污泥充分接触后，通过厌氧微生物的吸附、吸收和生物降解，使废水中的有机污染物转化为沼气。完全混合厌氧反应器（CSTR）池体体积较大，负荷较低，其污泥停留时间等于水力停留时间，因此不能在反应器内积累起足够浓度的污泥，一般仅用于城市污水厂的剩余好氧污泥以及粪便的厌氧消化处理。

另外，有相关资料表明，投加活性炭可大大缩短污泥颗粒化的时间;在投加活性炭后颗粒污泥的粒径大，并使反应器运行更加稳定。厌氧颗粒污泥的沉降速度应保持在50~150m/h之间；若沉降速度过快，说明污泥中的厌氧***比较少，钙等无机成分比较多；沉降速度过慢，厌氧颗粒污泥，在上升流速较高或者受冲击时，容易造成污泥流失。一般的，厌氧颗粒污泥报价，高温较中温的培养时间短，但由于高温下NH3与某些化合物混合毒性会增加，因而导致其应用上受一定的限制;中温一般控制在35℃左右。

当废水中的某种或多种营养元素缺乏时，将会严重影响产甲1烷菌的活性。这是因为，对厌氧污泥，厌氧颗粒污泥供应商，尤其是厌氧颗粒污泥来说，产甲1烷菌位于颗粒污泥的中心部位，水解酸化菌则包裹在产甲1烷菌的外围，厌氧颗粒污泥生产厂家，水解酸化菌较产甲1烷菌更容易获得这些元素来进行新陈代谢，再加之水解酸化菌的生殖速率又远远高于产甲0烷菌，使得废水中原本不足的营养元素被水解酸化菌利用殆尽。