企业对经过专项审计按研发项目建立的研发费用的各项支出，都要给予尽可能具体的说明，特别是对一些数额较大的原材料、仪器设备等支出费用要说明其在哪个研发项目的具体用途。要说明研发费用归集是用于项目研发过程的相关环节。理论上来说，1个发明或5个实用新型，能支撑知识产权评价部分得高分。至于说成果转化评价部分得高分，专利既非必要条件也非充分条件，企业有合理的途径、合理的证明就可以。由技术对企业申报的知识产权是否符合《认定办法》和《工作指引》要求，进行定性与定量结合的评价。科技成果转化是指为提高生产力水平而对科技成果进行的后续试验、开发、应用、推广直至形成新产品、新工艺、新材料，***高企认定，发展新产业等活动。
无论是从高企认定和评审的实操角度，还是从企业知识产权战略布局的角度来看，只要企业也有这方面基础和能力，还是应尽量多申请一些专利，毕竟有备无患。企业创新能力主要从知识产权、技术创新***管理水平、科技成果转化能力、企业成长性等四项指标进行评价。各级指标均按整数打分，满分为100分，综合得分达到70分以上（不含70分）为符合认定要求。研发项目立项时应设置研发支出专账或辅助账，核算各研发项目的各支出明细科目费用，以此作为研发费用专项审计依据，以备核查。
企业申请认定设立的研发项目必须符合《工作指引》要求。研发活动是为获得科学与技术新知识，创造性运用科学技术新知识，或实质性改进技术、产品（服务）、工艺而持续进行的具有明确目标的系统性活动。申报高企认定的企业在企业所得税汇算清缴上需要填报基础信息表、主表和要求列表的附表。老高企要求单独填报“高新技术企业优惠情况及明细表”。企业选择享受小型微利企业税收优惠的，免填“一般企业收入明细表”“一般企业成本支出明细表”“期间费用明细表”等附表的，需要提供相应免填情况说明。高新技术企业认定申报是一项性的工作。中间涉及的环节之多、要求之高，对大部分的企业来说都是很棘手的问题。很多公司对高新申程和材料编写缺乏经验，对政策了解不透彻等，终很容易导致申报失败。
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