目前，大肠菌群检测方法发展很快，已提高到分子生物学水平，使检测更快速、准确。酶底物法以其操作简便、检测周期短，将取代多管发酵法、滤膜法等传统方法，尤其是酶底物法采用密封培养技术，酶底物法试剂，在检测医院污水时可以减少人员接触而降低检测人员的致病风险，因此具有更强的实用价值和应用价值，正是目前水中粪大肠菌群的快速检测标准方法之一。
大肠菌群超标有什么危害?
大肠菌群超标有什么危害？举个例子说，你的九管检测法的阳性管数为210，假如你是用的2003版，则报告结果为150MPN/100g(mL)；假如是2016版，酶底物法设备，则报告结果为1.5MPN/g(mL)。但是同一个样品若是同时使用两种检测方法进行检测，检测结果并不会特别吻合，酶底物法仪，通常情况下，2016版检测样品的检测结果偏高。相反的，产品标准也会提示或者要求我们合理选择检测方法：假如某一产品大肠菌群的标准为<30 MPN/100g(mL)，那你肯定应该选择2003版的检测方法；若是产品标准为<0.3 MPN/g(mL)，那就只能选择2016版的了。
对于预包装食品
① 应采集相同批次、独立包装、适量件数的食品样品，每件样品的采样量应满足微生物项目检验的要求。
② 独立包装小于、等于1000g的固态食品或小于、等于1000mL的液态食品，酶底物法，取相同批次的包装。
③ 独立包装大于1000mL的液态食品，应在采样前摇动或用无菌棒搅拌液体，使其达到均质后采集适量样品，放入同一个无菌采样容器内作为一件食品样品；大于1000g的固态食品，应用无菌采样器从同一包装的不同部位分别采取适量样品，放入同一个无菌采样容器内作为一件食品样品。
对于散装食品或现场制作食品
用无菌采样工具从n个不同部位现场采集样品，放入n个无菌采样容器内作为n件食品样品。每件样品的采样量应满足微生物项目检验单位的要求。
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