蘑菇渣为主要原料生产有机肥的方法，将主料蘑菇渣以及辅料菜籽粕，草炭，干鸡粪其中一种混合，边混合边加水边将活化菌的均匀撒入，将混合后的菌原料保温，保湿条件进行发酵，在6-9天左右翻堆，大约20—30天左右发酵完成。
优点:发酵周期短;能***堆料中***菌，虫，虫卵，病原菌滋生，分解产生恶臭气体的有机物质，有机硫化物，有机氮等;用途广，可作有机肥用于各种植物生产作底肥或追肥，与相应土壤或珍珠岩等按比例混合后是很好的育苗基质，也是上好的盆栽各种花卉的基质原料。
蘑菇渣作为栽培基质必须有适宜的理化性质，易分解的有机物大部分分解，施入土壤后不产生氮的生物固定，通过降解除去酚类***物质，消灭病原菌、病虫卵和杂草种子。因此，必须对菇渣进行特定工艺的处理，方可作为栽培基质使用。
通常采用好氧堆肥法，利用微生物菌剂发酵作用，即高温堆肥发酵，将菇渣与填充料按一定的比例混合，在合适的水分、通气条件下，使微生物繁殖并降解有机质，从而产生高温，消灭其中的病原菌及杂草种子，使有机物达到稳定状态。
将辅料混合，加入清水搅拌均匀，蘑菇渣加工厂，用水泵向菇渣堆均匀喷洒，翻堆混合，直到含水量在50％左右，用手紧抓，指缝有水渗出，覆膜发酵。温度升高后，经常翻堆，使内外发酵均匀，保证温度在65以下。大概3个月时间，检查菇渣堆料颜色，发酵前堆料呈浅***，发酵后呈黑褐色，发酵前堆料有新鲜蘑菇味。
）菇渣的ph值一般为5-5.5，全氮含量为1.62%，全磷含量为0.454%，有机质含量60-70%。
2、不发酵直接使用的坏处
（2）未经发酵的菇渣中施加到土壤中后，容易引起病虫害。
（3）未经发酵的菇渣大多为有机态或者是缓效态，不能直接被作物吸收利用。
（4）菇渣在发酵过程中，蘑菇渣用途，会消耗较多的氧气，导致作物处于缺氧状态，求购蘑菇渣，进而影响作物的生长。
蘑菇渣的作用
（1）发酵过后，当做肥料使用。
（2）菇渣中的秸秆由于结构遭到***，质地松软，日照蘑菇渣，气味芳香，适口性良好，是一种不错的饲料。
（3）可以作为吸附剂使用。
（4）可以用作园林花卉，蔬菜的栽培基质。
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