净化车间的布局既要便于各生产环节的相互衔接，又要便于加工过程的卫生控制，防止生产过程交叉污染的发生。
食品加工过程基本上都是从原料→半成品→成品的过程，即从非清洁到清洁的过程。
因此，加工车间的生产原则上应该按照产品 的加工进程顺序进行布局，使产品加工从不清洁的环节向清洁环节过渡，不允许在加工流程中出现交叉和倒流。
清洁区与非清洁区之间要采取相应的隔离措施，以便控制彼此间 的人1流和物流，从而避免产生交叉污染，加工品传递通过传递窗进行。要在车间内适当的地方，设置工器具清洗，消毒间，配置供工器具清洗，消毒用的清洗槽，消毒槽和漂洗槽，食品洁净车间报价，必要时，有冷热水供应，热水的温度应不低于82℃。
半导体工业和工业已经越来越多地使用隔离器以提供ISO 4级（10级）或者更好的局部环境。现在隔离器供应商，例如LaCalhene，在报告中提到，食品饮料工业也采用这项技术，有下列理由：
卫生学——隔离器提供无菌环境，保护产品使其免受来自环境和操作者的污染，免受病原微生物和变异微生物的侵害。
销售——使用隔离器意味着不用借助于传统的防腐工艺就可以生产出自然的、无防腐剂的产品，因此，质地和产品的味道都不会受影响。
节省成本——使用隔离器可降低超净装置的安装和运行成本，延长产品储存期。普遍和频繁应用的是产品在无菌条件下配料、切片、填装和传送。 隔离器可以用在消毒生产线、试验装置和R&D实验室里。直接受影响的领域是易腐的饮料、奶制品、冷肉和海鲜、半成品菜、面包房和糕饼，以及鲜品的包装。
食品饮料工业净化工程洁净车间成本随清洁要求而不同。几乎没有ISO 3级和4级（1和10级）装置。ISO 5级（100级）洁净室成本是ISO 6级（1，000级）洁净室的两倍。成本随清洁要求的降低（见表2）而大大减少。只有一小部分食品洁净室利用了ISO 5级（100级）空间。真正经常使用ISO 5级标准的是在诸如填装生产线那样的小区域。因此，根据区域而进行的空间划分对更影响很大。
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