枯草芽孢是一种新型的微生物源生物。能在水稻体内迅速定殖和繁殖，可有效降低稻梨孢菌及其的积累，与其它***菌形成营养和空间位点的竞争。枯草芽孢可产生具有、抗病毒和生物表面活性剂作用的生物表面活性素。枯草芽孢产生的次生代谢产物对其他***病原菌孢子的细胞壁产生溶解作用，使***病菌的细胞壁穿孔、畸形等。另外，枯草芽孢作为微生物菌类，还能够促进植物生长。
枯草芽孢在动物体内作用方式：
枯草芽孢分泌多种促消化酶，提高饲料营养物质消化率：枯草芽孢以内生孢子的形式存在，当其进入消化道后内生孢子迅速复活并分泌活性很强的胞外酶，包括蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶等等； 促进肠道有益菌生长，减少腹泻：枯草芽孢迅速消耗肠道中的游离氧，间接***致病菌的繁殖。
调节作物生长一方面，枯草芽孢可促进作物生长；另一方面，枯草芽孢可提升抗病能力。
促进作物生长：枯草芽孢柑橘通过改良土壤，为作物的根系创造良好的环境及营养条件。此外，枯草芽孢分泌活性物质可刺激作物生长型内源占比上升，如、赤等含量增加，脱落酸含量降低等，有助于增产增收。
提升抗病能力：前面我们提到过，枯草芽孢可降低土壤中病原微生物的数量，但这只是其抗病作用的一部分。
枯草芽孢具备定殖能力，可以在作物根、茎、叶内部和土壤中成功定殖，当定殖量达到一定水平时(10^4 CFU/g)，可通过抢占空间与营养，阻碍病原菌对作物的侵染与伤害。
同时，枯草芽孢在定殖后可以产生、蛋白等活性物质使菌丝发生扭曲、肿胀和变形，进而***病原菌的生长，实现对病害的防治。