小型灭菌器，多用于门处理少量和用品，目前有100%纯或和二氧化碳混合气体。这类灭菌器自动化程度比较高，可自动抽真空，自动加药，自动调节温度和相对湿度，可自动控制灭菌时间。对中型和小型灭菌器的要求是：有较好的耐压性能和密闭性能，***灭菌厂家，应能承受1.25倍工作压力的水压试验，无变性和渗漏，可以抽真空度至53.3 kPa以上；加药量准确，保温性能好，可以调节消毒器内的温度和相对湿度；消毒后用外环境空气冲洗时，***灭菌电话，输入的空气经过滤器，可滤除≥0.3µm粒子的99.6%以上；排出的残余经无害化处理，灭菌物品中残留应低于15.2mg/m；灭菌环境中的浓度应低于2mg/m。
环氧灭菌时可采用100%纯环氧或环氧和二氧化碳混合气体。禁止使用氟利昂。解析可以在环氧灭菌柜内继续进行，也可以放入专门的通风柜内，不应采用自然通风法。反复输入的空气应经过过滤，可滤除≥0.3um粒子99.6%以上。环氧残留主要是指环氧灭菌后留在物品和包装材料内的环氧和它的两个副产品和乙二醇；接触过量环氧残留可引起灼伤和刺激。环氧残留的多少与灭菌物品材料、灭菌的参数、包装材料和包装大小、装载量、解析参数等有关。
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