目前，由于灵敏度所限，多数方法需要在标记和分析前对样品进行适当程序的扩增，***固定途径，不过也有不少人试图绕过这一问题，如 Mosaic Technologies 公司引入的固相 PCR 方法，什么是固定***，引物特异性强，无交叉污染并且省去了液相处理的烦琐； Lynx Therapeutics 公司引入的大规模并行固相法 (Massively parallel solid-phase cloning) ，可在一个样品中同时对数以万计的 DNA 片段进行，山东***固定，且无需单独处理和分离每个。
除了光引导原位合成技术外，有的公司如美国 Incyte Pharmaceuticals 等使用压电打印法 (Piezoelectric printing) 进行原位合成。其装置与普通的彩色喷墨打印机并无两样，所用技术也是常规的固相合成方法。做法是将墨盒中的墨汁分别用四种碱基合成***所替代，支持物经过包被后，通过计算机控制喷墨打印机将特定种类的***喷洒到预定的区域上。冲洗、去保护、偶联等则同于一般的固相原位合成技术。如此类推，可以合成出长度为 40 到 50 个碱基的探针，每步产率也较前述方法为高，可达到 99% 以上。
实际操作时需要注意的是，虽然共价偶联的方法优于物理吸附，***固定化，但基于氨基和羧基的***固定方法仍具有一定程度的随机性，有时在Fab区（用于结合抗原）存在易于修饰的氨基/羧基，在与固体表面偶联后会造成***的失活。在***领域，***与的偶联同样存在上面所说的问题（由于***表面可能存在很多可修饰的氨基酸，不能确定连在哪个部位
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