为了保证***芯片数据的可靠性，芯片中还需加.上多个持家***(housekeeping genes)作为内对照。持家***，如呼吸作用的酶类和细胞骨架蛋白***等，是维持细胞正常生长发育的必须***，其表达水平在细胞内基本不变。处理数据时，羧基处理的方法，认为持家***的反应信号在两种***中不变，依此确定其他***表达信号的相对值。
2.生物学意义分析
主要指通过分析芯片杂交数据，研究差异表达***的生物学意义。通常，天津羧基处理，在芯片中某一或发育时期可能有成千上万个差异表达***。例如，***芯片分析植物根部可能有400多个特意表达的***，如果要将这些***的来龙去脉都搞清楚，可能要追溯超过4000篇以上的文献(假设1个***需要查阅10篇文献)。这种不捡***的方法耗时耗力，所获得的结果也往往没有意义。
尽管如此，通常原位合成方法仍然比较复杂，羧基处理产品，除了在***芯片研究方面享有盛誉的 Affymetrix 等公司使用该技术合成探针外，其它中小型公司大多使用合成点样法。后一方法在多聚物的设计方面与前者相似，合成工作用传统的 DNA 或多肽固相合成仪以完成，只是合成后用特殊的自动化微量点样装置将其以比较高的密度涂布于纤维膜、尼龙膜或玻片上。支持物应事***行特定处理，例如包被以带正电荷的多聚赖酸或氨基***。现在已有比较成型的点样装置出售，如美国 Biodot 公司的点膜产品以及 Cartesian Technologies 公司的 PixSys NQ/PA 系列产品。前者产生的点阵密度可以达到 400/cm2 ，后者则可达到 2500/cm2 。
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