




RIP
技术概述
RIP是研究体内蛋白与RNA互作的重要技术。该技术先用甲醛等***交联细胞内的“蛋白-RNA”互作复合物,pcr检测,裂解细胞后,用靶蛋白特异的抗l体(或标签抗l体)做免l疫沉淀,获得“靶蛋白-RNA”互作复合物,去交联分离其中的RNA;针对预测的靶蛋白结合RNA的序列设计引物,
做qPCR实验,验证预测的RNA是否与靶蛋白有结合,徐州pcr,或者将分离出来的RNA做高通量测序,筛选到可能与靶蛋白结合的RNA。
技术流程
细胞交联-→细胞裂解-→免l疫共沉淀→去交联→RNA分离→建库→高通量测序(或qPCR)。

免yi共沉淀(Co-IP检测)是以抗ti和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的方法。当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质与蛋白质间的相互作用也被保留下来。用预先固化在beads上的蛋白质A的抗ti免yi沉淀A蛋白,那么与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来,荧光定量pcr,再通过蛋白变性分离,对B蛋白进行检测,进而证明两者间的相互作用。

RNA提取预备工作
RNA酶(Rnase)是导致RNA降解主要的物质。此酶非常稳定,在一些的条件下只可暂时失活,实时荧光定量pcr,但限制因素去除后又迅速***活性。常规高温高压灭菌方法和蛋白***ji不能使所有的Rnase完全失活。
1.它广泛存在于人的皮肤上,因此制备RNA时必须戴手套
2.RNase的又一污染源是取液器。根据取液器制造商的要求对取液器进行处理。一般情况下采用以DEPC配制的70%乙醇擦洗取液器的内部和外部,可基本达到要求。
3. 塑料制品、玻璃和金属物品的处理
(1)塑料制品:尽量使用一次性无菌塑料制品。已标明RNase-free的塑料制品,如没有开封使用过,通常不必再处理。
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