洁净厂房管道的内外壁应尽量光洁，管道及管件的接头处应有较好的平整度，以保证水流有较好的水力性能，以及降低微粒的沉积和微生物的繁殖。建议洁净厂房给水管材采用聚烯(PP)管或不锈钢管。连续排水温度高于80℃时，采用排水铸铁管，但应注意防腐处理。洁净厂房内的生产工艺对环境有较高的要求，需要对其生产车间的空气悬浮粒子浓度进行控制，同时，还需保证一定的温度、湿度和压力。
排水管材的选择，应针对排水的水质特点选用。洁净厂房内管道的敷设方式直接影响洁净室的空气洁净度，因此管道应尽量在洁净室外。给排水管道穿过洁净室墙壁、楼板和顶棚时，应设套管，十万级gmp净化车间，套管内管段不得有接头，管道和套管之间必须用不起尘的密封材料封闭。洁净厂房除了合理的工艺布局，恰当的室内装修，配套的安装工程设计亦至关重要，给排水工程设计就是其中一个重要的环节。
手是交叉污染的媒介，洁净厂房的工作人员在接触工作服之前应洗手，洗手的不应直接用手开启，可采用感应式或肘式洗手。洁净厂房内的生产用水系统可按生产线的数量，分别布置，建议每条生产线给水系统的起端均设置检修阀门及计量水表，以便检修和成本核算。我国净化工程行业，目前正值推广阶段。新建、改建净化工程，改善生产环境，提高工作效率，是一件很慎重的工作。
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