播种：将种子点在压好穴的盘中，每穴一粒，避免漏播，发芽率偏低的种子每穴播2粒。
覆盖基质：播种后用蛭石覆盖穴盘，方法是将蛭石倒在穴盘上，育苗盘，用刮板从穴盘的一方刮向另一方，去掉多余的蛭石，覆盖蛭石不要过厚，与格室相平为宜。
用穴盘育苗种苗起苗移栽简捷、方便，蔬菜育苗盘，不损伤根系，定植成活率高，缓苗 期短。
穴盘苗便于存放，运输。
播瓜类等大粒种子的穴孔基质不可太满；
避免挤压基质，否则会影响基质的透气性和干燥速度，而且由于基质压得过紧，多肉育苗盘，种子会反弹，导致种子终发芽时深浅不一。
育苗盘
育苗盘是非常好的扦插神器，尤其是扦插硬质枝条，当然月季枝条也能扦插，尤其在冬季，简直是存活率百，配置好基质以后，扦插成功的月季枝条几乎不用假植，拿出来直接上盆就行，当然如果用撞墙2.0的方法扦插，是要假植的，所以扦插配方很重要。
底盘
主要是控制水分的，在使用中，底盘主要是控制水位，因为水位太高，介质吸水能力差，还有一个就是水分太足容易导致黑杆，所以水位控制很关键。
一、穴盘选择
在使用蔬菜育苗盘进行育苗的时候，可以根据需求选择20孔、50孔、72孔、128孔、200孔或288孔等。不同规格的育苗盘，适合的蔬菜种类也不同，其中50孔的穴盘适合种植瓜类、茄子等，72孔的穴盘适合种植瓜类、豆类、茄果类、抱子甘蓝、冬春季番茄等，128孔的穴盘适合种植叶菜类、甘蓝类、短苗龄番茄、辣椒等。
二、基质选择
基质的选择很重要，基质应具备质地疏松、保水保肥性好、有机质丰富等特点，72孔育苗盘，目前多是将草炭土、蛭石按照2:1的比例配制，也可以将草炭土、蛭石、珍珠岩按照3:1:1的比例配制。为了避免土壤中有病菌的残留，还要进行消毒，可用多聚灵、百菌清、进行消毒。把消毒后的基质放到穴盘内，并进行压穴，深度是种子直径的2-2.5倍就行。
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