食品的质量卫生与杀菌设备有着较直接的关联，因此在选择杀菌设备前，先要弄清食品杀菌的意义。要得到好的杀菌效果，就要选择精良的杀菌设备。杀菌机械设备一般是指消除产品、包装容器、包装材料、包装辅助物、包装件等上的微生物，使其数量降低到允许范围内的机器设备。在无菌包装系统中，杀菌装置常作为多功能包装机的一个组成部件来完成杀菌操作任务。随着包装工业的发展，目前在许多食品工业的生产过程中，杀菌设备对食品质量起着重要的作用。
1、时间短、速度快
常规热力干燥杀菌是通过热传导，对流或辐射等方式将热量从物体表面传至内部。往往需要较长时间，物体内部才能达到所需的干燥度和杀菌温度。介质由极性分子和非极性分子组成，电磁场作用下，这些极性分子从原来的随机分布状态转向依照电场的极性排列取向。而在高频电磁场作用下，这些取向按交变电磁的频率不断变化，这一过程造成分子的运动和相互摩擦从而产生热量。此时交变电场的场能转化为介质内的热能，使介质温度不断升高，故微波加热是介质材料自身损耗电场能量而发热。所以微波加热处理时间大大缩短，在一定功率密度强度下，一般只要数十秒、几分钟即能达到满意效果。
2、低温干燥杀菌保持营养成份
微波有热效应的快速升温和非热效应的双重杀菌作用，相比常规热力干燥、杀菌能在比较低的温度和较短的时间就能获得所需的干燥、杀菌效果。一般杀菌温度在65—70℃，75—80℃或103—121℃里，时间在3—8分钟，且能保留更多的食品营养成分和色、香、味、形等风味。例如：采用常规热力处理蔬菜保留的***C是46—50%，相比之下，微波处理法能达到保留***C的60—90%，菊花灭菌机公司，常规加热法猪肝***A保留值为58%，而微波法加热则可达84%。
3、节约能源
微波电能转换，一般在70%以上。微波是直接对食品进行作用处理，加热箱体本身不被加热，因而不存在额外的热能损耗，所以节能省电，一般可节电30—50%。
微波杀菌设备当前运用范围较广，可对以下产品完成杀菌制作加工处理：
1、粮食类：面包、月饼、面条、豆腐、豆腐干等。
2、蔬菜类：泡菜、竹笋、香菇类等。
3、水果类：荔枝、龙眼等。
4、其它：乳制品、调味料、香料香精、方便面汤料、火锅调料及各种各样液体饮品。
微波杀菌设备食品加工工艺是运用微波对物质的场致作用来完成物料的加热、干燥、杀菌、烧结、合成、萃取、催陈等的特殊制作加工、在这当中干燥的基本目的是为了更好地去除物料中的水分;杀菌的目的是限制微生物和酶导致的问题;催熟、调温等是按照制作加工的对象，充分利用微波的一些特殊效果(如催熟、调温和解冻)完成制作加工。
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