压穴：装好的盘要进行压穴，以利于将种子插入其中，大棚育苗盘，可用专门制作的压穴器压穴，育苗盘，也可以将装好基质的盘垂直码放在一起，4～5盘一撂，上面放一只空盘，两手平放在盘上均匀下压至要求深度为止。
苗盘入床：将已播种的育苗盘铺放在苗床中，及时用清水将苗盘浇透，浇水时喷洒要轻而匀，防止将孔的基质和种子冲出，然后在苗床上平铺覆盖一层地膜，扦插育苗盘，以防止育苗盘内水分散失。
节能省工省力、。穴盘育苗采用精量播种，一次成苗，
增加育苗密度，便于集约化管理，提高温室利用率，降低生产 成本。
由于统一播种和管理，使小苗生长发育一致，提高种苗品质， 有利于规模化生产。
育苗盘
节省育苗场地和降低成本。用穴盘播种，让小苗在穴盘里生长，长大后再移入育苗钵、或开沟分苗、或定植；在育苗盘里播种这样开始占地少，尤其适于在早春温度低时培育小苗，外界温度升高后再移入其他保护地培育成苗，可减少加温费用。
底部无孔的可以用作化蛹盘，可孵化蚕蛹、蛋白虫等。
培育生长量较小的苗用穴盘，培育生长量较大的苗用育苗钵或在苗床开沟培育。
可大批量育苗，又可节省劳力。
穴孔形状以四方倒梯形为宜，这样有利于引导根系向下伸展，而不是象圆形或侧面垂直的穴孔中那样根系在内壁缠绕。较深的穴孔为基质的排水和透气提供了更有利的条件。
穴盘育苗在由填料、播种、催芽等过程中均可利用机械完成， 操作简单、快捷，适于规模化生产。
在种苗生产过程中重要的工作是水分管理。但是在实际工作过程中却常常由经验不多的人来做。在不恰当的时间或者用错误的方式浇水，会严重影响穴盘苗的生产。
不允许穴盘苗完全干燥；反之，基质中水分过于饱和也不行，会造成根系缺氧
如果浇水次数过多，那么植物容易徒长，西瓜育苗盘，减少基质透气性，对根系造成损伤，从而容易病菌。 温室内浇水是重要的任务，不应该一个没有经验的人去操作。浇水需要更多的是工人不断主动累计的经验而并非书面或者口头传授的知识。
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