不论沉水植物是否存在，藻类的生物量与湖水中氮、磷的含量呈正相关 。但藻类生命周期短，对水体中氮、磷营养盐固定能力弱，而沉水植物具有过量吸收营养物质的特性，个体大，生活周期长，体内积累的氮、磷多，储存较藻类稳定，能有效降低氮、磷循环速度、控制藻类的暴发 。
对于根系不发达的沉水植物如黑藻、伊乐藻、金鱼藻等，主要依靠自身叶片吸收水体中的营养盐，如NO3-、PO43-、CO2和HCO3-，水生苦草哪里有卖，进而与浮游植物形成竞争关系。研究表明，沉水植物苦草哪里有卖，大量沉水植物可以导致水体中磷含量急剧下降，造成浮游植物缺乏营养盐而难以在夏天形成水华。
当湖泊水体中氮磷营养物质过剩时，水体中浮游藻类会暴发性生长，覆盖水体表层，导致水体透明度降低，太阳光照无法到达沉水植物表面或光照不足以维持沉水植物的光合作用过程，十堰苦草哪里有卖，从而导致沉水植物的退甚至逐渐消亡，沉水植物的缺失会加剧湖泊水质的恶化，使湖泊生态系统由清水稳态向浊水稳态转化。
水下光场分布
富营养化导致的水质恶化，会对水体水下光场分布产生直接的影响。在透明度较高的长江中下游湖泊中，水下光照度大值出现在560nm左右，水生植物苦草哪里有卖，随着水深的增加，光照会逐渐衰减，但是衰减速率相对较慢
沉水植物除了通过根、叶吸收水体中的氮、磷及控制水体中营养盐浓度外，还可在光合作用过程中产生氧气扩散到根际并进入沉积物，影响沉积物氮、磷的循环。相关研究表明，沉水植物覆盖的区域中，氧气可以渗透至沉积物表层20 mm处，而在无沉水植物覆盖的区域，氧气的渗透深度仅4 mm；沉积物中的Fe2+在沉水植物根际氧化作用下形成Fe3+，并与PO43--P形成铁-磷复合体，***磷从沉积物释放到水体中。同时，沉水植物通过促进沉积物-水界面的反硝化作用，还原硝盐，释放出分子态氮(N2)或一氧化二氮(N2O)，减少水体中的氮营养盐。
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