当PCR循环阶段完成后，PCR扩增仪通常被设置为将样品“保持”在4℃，直到用户将其从仪器中取出。
将样品块冷却到这个温度，pcr仪，特别是长时间的冷却，会给样品块带来不必要的压力，并有可能使其寿命缩短10倍之多。为了避免这种情况，可以在程序结束后立即取出样品，或者将仪器设定为在室温下保持样品。
这对PCR产物的影响应该是小的，因为DNA在室温下是相对稳定的。此外，定量pcr仪，在低温下保持样品块，可能会导致冷凝水的积累。这不仅可能导致块状物本身的腐蚀，还可能损坏仪器内部的电气元件。
因此，当仪器不使用时，将PCR扩增仪的盖子打开，荧光pcr仪，让任何积聚的冷凝水蒸发，是一个好的做法。
灵敏度、准确性等指标
PCR仪的检测灵敏度指能检测到的量。一款好的荧光定量PCR仪是可以达到单拷贝检测灵敏度的。
准确性是指测量结果能够准确反应目标***的量，并且重复多次实验能够达到一致结果。你可以对比多款PCR仪，选取准确性相对较高的仪器。
温度控制功能
早期PCR仪的温控方式是模块控温，PCR扩增仪，现在普遍应用的是计算控温（也称管式控温）了。一些PCR仪可以实现温度梯度功能，即不同列或不同行之间可以实现不同温度。梯度温度对于***扩增研究来说是非常有用的功能。
实时荧光定量pcr仪，由荧光定量系统和计算机组成，用来监测循环过程的荧光。与实时设备相连的计算机收集荧光数据。数据通过开发的实时分析软件以图表的形式显示。原始数据被绘制成荧光强度相对于循环数的图表。原始数据收集后可以开始分析。实时设备的软件能使收集到的数据进行正常化处理来弥补背景荧光的差异。正常化后可以设定域值水平，这就是分析荧光数据的水平。
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