2.生物学意义分析
主要指通过分析芯片杂交数据，研究差异表达***的生物学意义。通常，在芯片中某一或发育时期可能有成千上万个差异表达***。例如，***芯片分析植物根部可能有400多个特意表达的***，如果要将这些***的来龙去脉都搞清楚，可能要追溯超过4000篇以上的文献(假设1个***需要查阅10篇文献)。这种不捡***的方法耗时耗力，所获得的结果也往往没有意义。
尽管如此，通常原位合成方法仍然比较复杂，除了在***芯片研究方面享有盛誉的 Affymetrix 等公司使用该技术合成探针外，其它中小型公司大多使用合成点样法。后一方法在多聚物的设计方面与前者相似，合成工作用传统的 DNA 或多肽固相合成仪以完成，只是合成后用特殊的自动化微量点样装置将其以比较高的密度涂布于纤维膜、尼龙膜或玻片上。支持物应事***行特定处理，例如包被以带正电荷的多聚赖酸或氨基***。现在已有比较成型的点样装置出售，醛基化处理的·方法，如美国 Biodot 公司的点膜产品以及 Cartesian Technologies 公司的 PixSys NQ/PA 系列产品。前者产生的点阵密度可以达到 400/cm2 ，后者则可达到 2500/cm2 。
由于尚未形成主流技术，生物芯片的形式非常多，醛基化处理，以基质材料分，什么是醛基化处理，有尼龙膜、玻璃片、塑料、硅胶晶片、微型磁珠等；以所检测的生物信号种类分，醛基化处理载玻片，有核酸、蛋白质、生物***碎片甚至完整的；按工作原理分类，有杂交型、合成型、连接型、亲和识别型等。由于生物芯片概念是随着人类***组的发展一起建立起来的，所以至今为止生物信号平行分析成功的形式是以一种尼龙膜为基质的“cDNA阵列”，用于检测生物样品中***表达谱的改变。折叠
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