所谓水质，主要是指水的硬度和酸碱度。
水的硬度是根据水中含钙、镁、铁盐的含量多少而定的。分为硬水、软水和中性水井水、泉水多属于硬水；自来水、河水则大多数属于中性水；雨水属于软水。养殖热带鱼应该使用中性水，但城市中的自来水虽说酸碱度基本合乎热带鱼生活的要求，但由于水厂在处理水时经常要加一些化学成分的***和净化剂，应此水中常含有微量的和碱的成分，用来养鱼必须进行处理，常用的办法就是晾晒法，即将水在烈日下晒2~3天，或者是在阴凉缺光处晾一周才可以使用。
这些活生物石是海底取上来的珊瑚礁岩，上面存活有大量的海洋生物，放入水族箱内可以产生原来在海底时的自然生态生物。但是，这些活生物石在采集、搬运、运输过程中，遭遇日晒风吹，与空气接触之后，就使许多活生物，若不经处理直接把它放入水族箱内，这些死生物的残骸便需要在箱内硝化分解，在刚建立的水族箱中硝化系统根本没有足够的硝化***来硝化如此大量的污染源，这样就会使水质变坏变成，甚至还有臭味产生。故使用活生物石需要经过妥善的包装运输和适当的清洗整理才行。我们在的4～6星期中，每周定期用喷水器清洗活生物石，将清洗干净的活生物石放人才是安全的。或者用晒干的生物石，冲冼干净再放入水族箱。总之，采用活生物石是很重要的，但一定要注意清洗干净。
循环水流
因为硝化***在进行硝化作用的过程中，实木鱼缸类型，需要消耗极高的氧气，因此，如何在水循环的流程内，把充分的氧气及水中待分解的有机质平均的送进过滤材料中，让硝化***有效地把它分解完毕，是设计循环水流的重要考虑点。我们必须认识到，太大的水流会令硝化***无以立足，无法生成密实的硝化网。太缓的水流又无法达到输送氧气及有机物的功能，产生一些死角，造成厌氧区，累积不必要的氨及等废气，反倒不利水质的安定性。
有力的水流
水流运动可使水族箱中的每一个地方，如角落、裂缝、洞穴以及珊瑚周围的水都能够得到不停的更换。我们必须设法防止有水流静止的区域存在。水流的运动就能使无脊椎动物上的单细胞虫黄藻的代谢产物会因水流的运动被清除。而有机物的食物也会因水流作用被送到生物栖息地附近，使他们更容易摄食。
综合上述，水族箱的水流是很重要的，用循环式水泵在水族箱中制造每小时至少5次的水流循环速度是较理想的，采用两个泵，使水流每6小时更换一次方向，定时开关，就更好了。
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