Micro CT不仅在活1体动物和离体***的分析研究中具有重要的应用，也在植物方面有着特殊的应用价值。可广泛应用于植物种子三维结构研究，无损探索种子腔体、胚和胚乳的变化；分析原位研究土壤中根系的三维形态结构；研究果实内部结构变化；以及植物茎流和植物水分等。通过Micro CT对果实的无损扫描，骨质疏松MicroCT，也可观察到果实的内部结构，在营养学研究与蛀虫病检测方面有极大的帮助。
骨关节1炎（osteoarthritis， OA）是以关节软1骨下骨硬化或囊1性变，关节边缘骨质增1生，滑膜增1生，种子MicroCT，关节间隙变窄为主要特征。建立OA动物模型是寻找******有效治1疗措施的重要途径。因Micro CT 可探测骨1髓和骨皮质的微小结构改变，与其他影像学方法相比，在评估小关节中有很大的优势。利用Micro CT可以评估骨性***进展中软1骨下骨质的微小变化，评估骨密度以及软1骨下骨化情况来研究骨性***的病理生理，以及软1骨中的钙质沉积变化。
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