种子内部的形态学信息参数，以及胚芽和胚乳区域的瑕疵率等，是评估种子的出芽率和质量的关键信息。传统方法常采用内窥镜来分析种子内部的形态，MicroCT，然而这种方法只能获得有限的投影，受种子放置方位的影响，很多缺陷无法体现。
而Micro CT通过投影重建、三维成像功能，可提供种子的不同角度的观察，对于种子内部结构展现更加全1面，例如裂隙、内部萌芽情况评估、病虫害情况等等。
卷积 卷积（convolution）是图像重建运算处理的重要步骤。卷积处理通常需要使用滤波函数来修正图像，卷积结束后形成一个新的用于图像重建的投影数据。
配准 配准（registration)的过程就是寻求两幅图像间一对一映射的过程，样品处理MicroCT，即，将两幅图像中对应于空间同一位置的点联系起来。图像配准通常是图像融合（infusion）的前提条件。
容积扫描 由于螺旋CT的速度大大快于非螺旋CT，而且采集的往往是一个器1官的扫描数据 （容积采集区段）而不是一个层面的数据，因此这种扫描方法称为容积扫描（volume scanning）。
。CT扫描采集的数据是离散的、不连续的，需要从两个相邻的离散值求得其间的函数值。内插的方法有很多种，例如线性内插、率过内插和优化采样扫描等。重建 原始扫描数据经过计算机采用特定的算法处理，得到能够用于诊断的图像，扫描牙齿MicroCT，这种处理方法或过程称为重建。图像重建速度是衡量CT机性能的一个重要指标。
重组 重组（reformation）是不涉及原始数据处理的一种图像处理方法，如多平面重组、三维图像处理等，即，在横断面图像的基础上，重新组合或构建成三维影像。由于使用已形成的横断面图像，因此重组图像的质量与已形成的横断面图像有密切关系。
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