卧式加工中心的坐标系与立式加工中心的坐标系，即X、Y、Z三轴在空间上是不同的。另外，卧式加工中心冷却条件不如立式的好，特别是对深孔的镗、铣、钻等，冷却液难以到达切削深处，因此，必须降低机床的转速和进给量，这就降低了生产效率。与立式加工中心相比，卧式加工中心的功能多，在立式加工中心上加工不了的工件，在卧式加工中心上一般都能够加工。此外，卧式加工中心的回转工作台有的是数控的，有的是分度的，工件一次装夹可实现多个工位的加工。
影响机床加工精度的因素
1、原理误差。机床加工的方式有很多，在加工的时候对于工件的形状形成原理不了解，或者是对工件的基本性质不是很清楚，那么就很容易产生原理误差，如，加工中心多少钱一台，由于判断失误，选择的预加工的要求不符的刀具，或者采用的传动方式不正确等。
2、机床刀具或者夹具的误差。机床加工材采用的刀具或者夹具本身的质量或者规格有问题，也会导致机床加工的工件精度不准确，导致刀具或者夹具误差的因素主要有生产制造的不合格和刀具在使用过程中磨损严重。
3、夹装误差。工件加工的过程中，需要将原零件手动夹装，那么在夹装的过程中就要用丰富的经验来判断夹装的***与松紧程度，因而这也是很容易导致精度较差的原因。
4、工件应力。机床加工的过程中，被加工的工件应力发生加大的变化，会对工件的基本形状产生影响，从而导致误差，这种误差很难避免，需要不断的实践，以排除这种可能
箱体类零件
箱体类零件是指具有一个以上的孔系，并有较多型腔的零件，这类零件在机械、汽车、飞机等行业较多，如汽车的发动机缸体、变速箱体，机床加工中心，机床的床头箱、主轴箱，柴油机缸体，五轴数控加工中心，齿轮泵壳体等。
箱体类零件在加工中心上加工，一次装夹可以完成普通机床 60 ％～ 95 ％的工序内容，合肥加工中心，零件各项精度一致性好，质量稳定，同时可缩短生产周期，降低成本。对于加工工位较多，工作台需多次旋转角度才能完成的零件，一般选用卧式加工中心；当加工的工位较少，且跨距不大时，可选立式加工中心，从一端进行加工。
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