原料的选定对生产工艺的选择、运城花卉有机肥生产设备的选择、发酵车间和加工车间的面积太小的选择都有很大影响，所以要先确定原料的选择。原料的选定一定要因地制宜、 就地取材。 有机肥的原材料有很多，当地什么原料比较多，价格比较低，那就选择什么材料做有机肥，有免费的那就更好了。那么有机肥的原料有哪些呢，具体可以分为以下几大类:
农业废弃物:比如秸秆、豆粕、棉粕、菇渣、沼渣、菌渣、木质素渣、木屑等。畜禽粪便:比如鸡粪、猪粪、牛羊马粪、兔粪、鹌鹑粪、蚯蚓粪等;工业废弃物:比如酒糟、醋糟、木蓉渣、糖渣、中药渣等;生活垃圾:比如餐厨垃圾、城乡生活垃圾等;城市污泥:比如河道淤泥、下水道淤泥、 塘泥等。
运城花卉有机肥就是指以有机化合物主导的当然化肥，多是动物和人的粪便及其动物与植物残体，一般分成农家肥、绿肥和腐植酸肥三类。农家肥是农民将人和动物粪便及其其他原料生产加工而成的，普遍的有厩肥、沤肥、沼液肥、熏土和草木灰等。获得绿色植物以及生产加工残物都是一类具备不错运用使用价值的农家肥，在其中大豆饼、棉籽饼等饼粕类养分含量较为高，非常是氮都会5%左右。麦草和秸杆养分较低，一般总养分在2--3%。 
近几年，将生化制药厂的固形废弃物经微生物法腐熟处理后制成的运城花卉有机肥，在农业的实际生产中表现出了良好的效果，这是由于生化制药厂生产的培养基都会加入淀粉类和饼粕类组分。这些生化后期的废弃物，在前些年往往被用于加工饲料，鉴于食品安全的因素，后来被***明令禁止往饲料中添加。但这些废弃物中的成分其营养价值非常高，经腐熟处理后用做有机肥料则效果非常显著。直接用饼粕来生产运城花卉有机肥，由于原料成本太高，目前市面上尚未发现，而标识“豆粕有机肥”的产品到底是否含有豆粕、含有多少豆粕，我们很难评判。