无菌技术是按照严格的操作规程和管理制度，利用消毒和灭菌方法阻断微生物及其途径，其目的是阻断微生物经***、插管、换药、穿刺以及***等操作***伤口或***引发。无论是传统***还是内镜***，必须严格无菌操作，若腔镜器械上留有血迹或蛋白质等有机物，就会影响消毒灭菌效果。
腔镜器械所涉及较多，种类较多，且价格昂贵，结构复杂、精细，因此对清洗和消毒灭菌的要求也更高。有研究表明，使用含氯消毒液清洗腔镜器械的效果好，但氯离子具有一定的腐蚀作用，对腔镜器械有一定损害，因此不能使用含氯消毒液对腔镜器械进行消毒灭菌。
内镜相关操作的职业防护措施
(1)加强内镜室医护人员知识培训学习，提高自我防护、医源染防范意识；
(2)内镜检查前先确定患者有无性***，如先检查HIV、HBs抗原、HCV等；
(3)在诊疗过程中，做好标准预防。医务人员操作时必须穿专用工作衣、专用工作鞋，戴防护眼镜、***口罩、帽子、橡胶手套等，并且一患者一更换手套。每位患者之间更换枕巾、口圈、弯盘等；
(4)正确洗手（六步洗手法）是预防***传播和安全防护的、的方法；
(5)进行内镜的清洗消毒时，一定要在通风良好的环境中，并且要戴好***口罩、帽子、手套、护目镜、穿专用工作衣等，以防止化学***溅入眼内并减少吸入；
机械清洗消毒
经手工预处理后采用全自动清洗消毒器，对内镜进行集中、1统一清洗消毒，运行预先设定好的清洗消毒程序，一次性完成内镜的清洗、漂洗、消毒、干燥。清洗前，将硬式内镜装载于专用清洗架上，确保器械表面和官腔内部得到彻底清洗，其他器械应放置于清洗篮筐中清洗。
根据硬式内镜灭菌方法选择相应的包装。适用于压力蒸汽灭菌的，注意按照说明书选择温度与压力；对于不耐热的部件可采用低温等离子灭菌，其处理效率快，与大部分器械兼容