预防内镜破损是延长内镜使用寿命的重要因素之一，而早期发现内镜破损的有效办法就是每次清洗前进行测漏。从保护镜子和保证洗消效果的角度，宜每次清洗前测漏；条件不允许时，应至少每天测漏１次。“规范”建议内镜自动清洗消毒机宜具备测漏功能。由于在测漏时需要旋转大小角度钮，使内镜先端向上、下、左、右各个方向弯曲，仔细观察有无气泡冒出，再观察其他部分，才能及时发现管道及外皮的细小漏水情况，而自动清洗消毒机虽然有测漏功能，但不能旋转大小角度钮，因此只有内镜出现较大破损时才能发现，故即使使用自动清洗消毒机也必须***行手工测漏；另外，鉴于国内大多数***内镜数量不能满足患者的诊疗需求，每次使用后即测漏可操作性较差，因此规定“内镜使用后宜每次清洗前测漏；条件不允许时，应至少每天测漏１次”。但该要求并未达到发达***的标准。
清洗流程如下：
a）在清洗槽内配制清洗液，将内镜、按钮和阀门完全浸没于清洗液中。
b）用擦拭布反复擦洗镜身，应***擦洗插人部和操作部。擦拭布应一用一更换。
c）刷洗软式内镜的所有管道，刷洗时应两头见刷头，并洗净刷头上的污物；反复刷洗至没有可见污染物。
d）连接全管道灌流器，使用动力泵或将各管道内充满清洗液，浸泡时间应遵循产品说明书。
e）刷洗按钮和阀门，适合超声清洗的按钮和阀门应遵循生产厂家的使用说明进行超声清洗。
f）每清洗1条内镜后清洗液应更换。
g）将清洗刷清洗干净，高水平消毒后备用。
打弯的角度要合适。在手持或者清洗的时候打弯角度不要太小，否则易造成内镜内部折叠变形；在附件插入时也不宜打弯角度过小，蛮力塞入容易导致内部管道损伤。
6、推荐使用具有生物膜去除能力的清洗剂。研究表明软式内镜的管道结构复杂且不容易做到彻底干燥，是生物膜滋生的场所。使用针对生物膜的清洗剂能够有效降低生物膜的挑战。
7、清洗刷要一用一换。防止将清洗上一条内镜时裹挟的污物带到下一次内镜清洗中造成。
8、清洗、漂洗流程。清洗、漂洗过程中使用的内镜擦拭布应一用一更换，清洗液（多酶洗液）也应每清洗一条内镜后及时更换。
9、可复用的内镜附件处理方法。可复用的内镜附件使用***消毒后，应采用纯化水或无菌水漂洗干净，干燥备用，而不是自来水。
10、使用说明。不同种类的内镜，或者相同种类但由不同厂商生产的内镜，其使用消毒或者灭菌方式可能不同。应购买后、使用前仔细阅读厂商说明书。