明清祠堂建筑的区别主要体现在：
祠堂建筑的"三雕"即木雕、砖雕、石雕，有负载传达信息的任务，有劝谕、认知、教化的作用。明清两代的"三雕"达到了"图必有意，祠堂建筑设计，意必吉祥"的程度。如"闻鸡起舞""樵夫晚归"是教育人们勤劳奋发；"寒窗苦读""状元游街"反映的是读书做官：梅花寓意傲霜斗雪、松树寓意坚强不屈；竹枝与花瓶组合为"竹报平安"；两只柿子与一只如意相配为"事事如意"等等。
祠堂维修工程
修复中除对劈裂部位采取粘接和碳纤维套箍加固，木柱表面经敷漆后无凸起。对除檐柱外的其他局部严重破损处且在不影响外观的前提下，在靠近木柱的梁枋端部增加抱柱，以减轻木柱的受重负荷，这种方法应考量现场条件，因为“加法”在祠堂的修复中要尽可能谨慎使用，以维持建筑遗产原真性少受伤害。根据文献经验，凡嵌补用木料均应做防腐处理。
建造祠堂的风水知识
现代祠堂从整体布局上也要讲坐势、朝案。祠堂建筑首先必须观察地形、地势和面积，广东祠堂设计，这里也应该考虑祠堂建筑群的体形组合以及空间的处理，以地形、地势的特点作适当的布置，因地制宜。把美的建筑形式衬托出来，获得良好的艺术效果。
它不仅要满足祠堂功能的要求还要考虑其它配套设施的相互关系、比例、尺寸等，所以说祠堂选址理想模式：地宽基平，背山依水，农村祠堂设计，交通方便，景色优美，祠堂门楼设计，同时考虑顺应自然，利用自然，装点自然。
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