内镜清洗的方式是先手工清洗再机械清洗。手工清洗后，应当按照内镜生产商提供的使用说明书，软式内镜应该机械清洗并暴露于高水平***或液体化学灭菌剂中进行机械处理，或机械清洗和灭菌。机械处理包括机械清洗、机械高水平消毒或灭菌和机械漂洗。大量证据表明，机械处理可提高清洗效率，提高工作效率，减少人员清洗职业暴露，并且可以更成功地监控质量和一致性，但目前手工清洗仍是必需的。
手工清洗还是机器清洗？
清洗效果直接决定消毒效果，特别是对于软式内镜，更多的是依靠化学消毒及灭菌，如等***短时间达不到高水平消毒，目标微生物的减少主要是清洗，残留污染物将显著影响消毒效果，所以清洗质量非常关键。
究竟是采取哪种方式清洗，面临比较大的问题，目前常常将两种清洗方式对立起来了。机器清洗对保证清洗质量的稳定性似乎更好一些，但强调机器清洗之前应该手工清洗。
清洗剂的问题
清洗剂是增强水的去污能力的化学制剂，因此水是关键。对内镜的清洗来说，质量不好的清洗剂特别是部分泡沫较多的，机洗效果甚至不及清水，这一点需要特别关注。
清洗剂目前存在的问题：
1.不属于消毒产品，也不属于。
2.没有资质、批件问题，进入门槛低。
3.国际上没有通用标准，我国《***清洗剂卫生要求》已经制定待发布。
4.市场较为混乱，质量参差不齐，需要***自我识别。
内镜清洗剂与普通清洗剂的区别：
经过了安全性评价。
针对器城，不是衣物或餐饮具。
腐蚀性低。
有去除金属离子的作用。
低泡。
可能有其他特殊作用。