当TS16949体系运行到一定的阶段，需要进行TS16949认证内部审核，TS16949认证咨询人员则应指导企业进行内部质量管理体系审核员培训。这项工作是为评价质量管理体系运行的符合性和有效性，所做人力资源培养的重要基础工作。内部质量管理体系审核员将成为企业贯标工作的主力***和骨干力量。选定标准的内部质量管理体系审核条款中规定了企业实施内审的相关要求；推行TS16949认证有利于加强科学管理，提高经济效益，提高企业形象。规定了要培养出能评价本标准各个过程运行情况的有资格的TS16949认证内审员。可以看出对内审员的选拔和培训必须引起重视。因为这项工作，对准确评价质量管理体系的运行效果能产生因果关系的深远影响。在实施TS16949认证的内审员培训前，要做好相应的准备工作。
TS16949在前言和总则中已经自我申明，它的意图是保证一个***能稳定地向它的顾客提供符合约定要求的产品，是质保能力、产品提供/服务提供能力的一种保证。换句话说，它没有说，通过标准验收的企业，它的产品必然达到什么质量等级。一个没有通过TS16949认证的企业，它的产品，有可能比通过TS16949认证的企业的产品，实物质量高很多。2、管理者代表要真正在TS16949认证体系运行事宜上，行使自己职责和权限。
对TS16949认证内部审核中发现的每一项不符合项，TS16949认证内部审核组都要要求责任部门分析原因，制定纠正措施，并规定纠正措施的完成期限。当纠正措施按期完成后，质量管理部门要***内审组对纠正措施完成情况进行跟踪验证，以评价纠正措施实施的有效性。对纠正措施实施效果达到要表的不符合项，审核组要给予验证通过。对纠正措施验证没有达到规定要求的不符合项，要求责任部门重新采取纠正措施，待整改完成后，由内审组进行再次验证。直到验证纠正措施实施有效为止。在TS16949认证中，对于高层管理者参与符合性审核的相关要求如下：1、要熟悉TS16949认证标准条款对高层管理者的相关要求。
内部审核评价防止不符合项的发生：通过定期监督检查质量体系工作的开展情况，发现并解决“执行”与“程序文件”的有效性和符合性问题，从而保障质量体系工作正常有序的进行和运转。对管理者的决策、质量方针和目标、***自身的规定、合同的要求等方面进行检查和审核，评价其有效性和效率；验证***自身的质量管理体系是否持续有效的实施和保持；TS16949的5大工具作用：1、使产品质量策划减少对客户和供应方的复杂性。依据质量管理体系的要求和标准，对***一系列的活动和过程进行检查，评价***自身的质量管理体系是否符合质量方针、程序和管理体系及相应***的要求。当TS16949认证体系建立、完善并有效运行后，如何保持质量管理体系有效运行就成了一个关键的任务。TS16949认证咨询人员要适时指导企业，在保持质量管理体系有效运行上采取合适的方法。确保质量管理体系运行的结果满足标准和文件的要求。
在TS16949认证审核时，内审员可采用现场交谈和抽样的方式进行审核。对抽样方案的策划一定要科学合理，以便降低双方(审核方与被审核方)的风险。对审核时发现的不符合项，内审员要及时与受审核方共同确认。在整个TS16949认证审核过程中，内审员要保持客观、公正、严谨、***、务实的原则。为被审核方创造一个轻松愉快的环境。民营汽配小企业生产一般以经验为主，检测缺手段，主要凭多年的经验为准，缺乏科学的管理手段，市场竞争能力差，推行TS16949质量认证有利于提高产品质量，尽早尽快进入国际市场。 民营小企业生产现场一般地方较小，设备、人员挤在一起，容易出现脏、乱、差的情况。推行TS16949认证有利于加强科学管理，提高经济效益，提高企业形象。因为这项工作，对准确评价质量管理体系的运行效果能产生因果关系的深远影响。
对TS16949认证符合性审核后纠正措施的完成及改进，是指在符合性审核过程中，由内部质量管理体系审核员在现场审核时，对发现不符合现象开出的不符合报告所进行的整改过程的控制方法和手段。要注意的是对不符合项的原因分析和纠正措施的制定要由责任部门来完成，受审核部门不一定是责任部门。必要时，可依据企业的经济责任制的相关要求进行奖罚，通过上述方法，能引起各部门。