微生物在活动中或死后所排出的物质，不只是氮、磷、钾等无机养分，还能产生谷酰氨酸、脯氨酸等多种氨基酸，多种***，还有细胞分裂素、植物生长素等植物ji素。少量的***与植物ji素，就可给作物的生长发育带来巨大影响。
提高解读效果，净化土壤环境，有机肥料有解读作用。例如：增施鸡粪或羊粪等有机肥料后，土壤中***物质对作物的读害可大大减轻或消失。
有机肥料的解读原因在于有机肥料能提高土壤阳离子代换量，增加对镉的吸附。同时，有机质分解的中间产物与镉发生螯合作用形成稳定性络合物而解读，***的可溶性络合物可随水下渗或排出农田，提高了土壤自净能力。有机肥料一般还能减少铅的供应，增加的固定。
而且***倡导使用有机肥料，改善修复因长久使用化学肥料对土地造成的***，而金宝贝有机肥发酵剂发酵肥料速度快，一般动物粪便三到五天即可彻底发酵完成，发酵好的有机肥料使用稳定养分充足，改善土壤、粮食增收、成本低廉等等诸多优势。
生物学研究表明，根系不仅仅是吸收水分养分的气官，还会根据感受土壤的养分状况产生化学信号，并将这些信号传递到地上部分，从而控制地上气官的生理活动，比如气孔开闭、叶片的扩展、果实的发育等等。因此，建立并保持一个健康的根系，对于地上部茎、叶、果实的正常发育是非常非常重要的。
常规的施肥措施虽然能提供给植物养分，但是具体这些施肥措施给了作物多少养分，只有根系才知道需要什么养分，需要多少，什么时候需要，并主动获助它们。因此，促进根的发育是***栽培的基础！
使用微生物菌剂需要注意5个事项
注意1：
氮、磷、钾总含量超过7%时与菌混合，会***菌的活性。菌与化肥混合时，一定要注意肥料中的氮、磷、钾总养分不要超过7%，一旦超过会***菌的活性，如果氮、磷、钾总养分大于7%，建议随用随混。目前，有些厂家的复合微生物菌肥中的氮、磷、钾总养分达到10%以上，有的甚至达到25%以上，这对于一般的jun种来说，都会造成菌活性降低甚至造成部分亡。但如果厂家选用的是耐化肥的jun种，就可以保证菌肥肥效。
注意2：
不要将菌肥与杀菌剂、***和含硫的化肥(如***钾等)以及稻草灰混合用。因为这些药、肥，很容易杀生物菌。或者先施菌肥，隔48小时后，再打药除草。若拌种，切忌和已拌好杀菌剂的种子混合使用。还应防止与未腐熟的农家肥混肥。
注意3：
对于已多年施用化肥的田块，施用生物菌肥时不能大量减少化肥和有机肥的施用量，因农作物对化肥产生了依赖性，用生物菌肥取代化肥不能一下子适应。因此，其取代量应做到第壹、第二、第三年分别取代30%、40%和60%，磷、钾肥只能补足，不能减少。
注意4：
在施用方法上，建议采用沟施、窝施的方式，一定要将菌肥盖在土壤里，避免阳光直射，紫外线会杀四***；如果是单一的微生物菌肥，建议将菌肥埋在作物根系附近，以增加肥效；此外，不建议冲施微生物菌肥，因为加水稀释后菌群会被冲散，影响施用后的效果。
注意5：
高温过高、过低、干旱条件下的农作物田块不建议施用微生物菌肥。