生物有机肥与精制有机肥相比：
精制有机肥是畜禽粪便经过烘干、粉碎后包装出售的商品有机肥。
1）生物有机肥完全腐熟，不烧根，不烂苗；精制有机肥未经腐熟，直接使用后在土壤里腐熟，会引起烧苗现象。
2）生物有机肥经高温腐熟，杀1死了大部分病原菌和虫卵，减少病虫害发生；精制有机肥未经腐熟，在土壤中腐熟时会引来地下害虫。
3）生物有机肥中添加了有益菌，由于菌群的占位效应，减少病害发生；精制有机肥由于高温烘干，杀1死了里面的全部微生物。
4）生物有机肥养分含量高；精制有机肥由于高温处理，造成了养分损失。
5）生物有机肥经除臭，气味轻，几乎无臭；精制有机肥未经除臭，返潮即出现恶臭。
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生物有机肥对土壤的作用
改善土壤理化性质
微生物可以促进土壤团粒结构的合成，而有机—无机团聚体是土壤肥沃的重要指标，它含量越多，土壤物理性质越好，土壤越肥沃，保土、保水、保肥能力越强，通气性能越好，越有利于作物根系生长。提高了化肥的利用率，减少了化肥对农田环境的污染，从而保证了农田的生态环境，对农业的可持续发展起到了积极的作用。板结的土地之所以不易于耕种，就是因为其团粒结构差，土壤不透气，不保水，根系及有益活性菌难以生长，因此作物发育不了，极易得病。
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生物有机肥施肥的误区
误区六：只注重施肥数量，不注重养分含量
现在市场上出现的一些复合肥，因单位价格较低，在农村应用较为广泛。6倍，因此，开发和利用固氮生物资源是充分利用空气中氮素的一个重要方面。这些复合肥普遍存在有效成分含量低或三大元素中某种元素含量很低或根本不含的现象，但农民对这些情况重视不够，仍延续高含量复合肥的施肥习惯，结果施入的氮、磷、钾不足，造成作物缺肥、缺素症的发生，影响产量和质量。因此，在使用这些复合肥时，应充分了解这些复合肥氮、磷、钾的含量，并根据各种作物需肥特性，配合使用氮、磷、钾等单元素肥，确保作物正常生长。