根据透水量或透水质量的变化，当超滤系统的透过水量或透水质量下降到不可接受程度时，说明透过水流路被阻，或者因浓度极化现象而影响了膜的分离性能，此种情况，多采用物理——化学相结合清洗法，即进行物理方法快速冲洗去大量污染物质，然后再用化学方法清洗，以节约化学***。
定时清洗，运行中的超滤系统根据膜被污染的规律，可采用周期性的定时清洗。可以是手动清洗，对于工业大型装置，则宜通过自动控制系统按顺序设定时间定时清洗。
加药灭藻法：在取水湖泊或原水存贮池中定期投加***铜(2～3mg/L)，可以杀灭藻类或控制其繁殖。但此法对鱼类***的作用。在净水工艺中采用预氯化法，可以控制藻类在净水构筑物中的生长。水中的藻类：除了会使水产生令人厌恶的味和嗅外，还因为它们的比重接近于水，混凝沉淀的效果不好，易于堵塞滤池，影响水厂的正常运行。因此在处理藻类含量较多的湖泊水时，应考虑反渗透超滤设备除藻问题。
超滤是一种加压膜分离技术，即在一定的压力下，使小分子溶质和溶剂穿过一定孔径的特别制的薄膜，
而使大分子溶质不能透过，留在膜的一边，从而使大分子物质得到了部分的纯化。超滤也是一种膜分离过程原理，超滤利用一种压力活性膜，在外界推动力(压力)作用下截留水中胶体、颗粒和分子量相对较高的物质，而水和小的溶质颗粒透过膜的分离过程。通过膜表面的微孔筛选可截留分子量为3x10000—1x10000的物质。当被处理水借助于外界压力的作用以一定的流速通过膜表面时，水分子和分子量小于300—500的溶质透过膜，而大于膜孔的微粒、大分子等由于筛分作用被截留，从而使水得到净化。也就是说，当水通过超滤膜后，可将水中含有的大部分胶体硅除去，同时可去除大量的有机物等。
