根据物品上污染微生物的种类、数量选择消毒或灭菌的方法：1) 对收到致病菌芽孢、分枝和经学传播病原体污染的物品，应采用高水平消毒或灭菌；2）对受到、亲水病毒、螺旋体、支原体、衣原体等病原微生物污染的物品，应采取中水平以上的消毒方法；3）对受到一般***和亲脂病毒等污染的物品，应采用达到中水平或低水平的消毒方法；4）杀灭被有机物保护的微生物时，应加大的使用剂量和/或延长消毒时间；5）消毒物品上微生物污染特别严重时，应加大的使用剂量和/或延长消毒时间；
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臭氧对空气中的微生物有明显地杀灭作用，锅炉改造用灭菌设备工作原理，采用30mg/m3浓度的臭氧，作用15分钟，对自然菌的杀灭率达到90%以上。用臭氧消毒空气，必须是在人不在的条件下，消毒后至少过30分钟才能进入。可用于***室，病房，无菌室等场所的空气消毒。臭氧对表面上污染的微生物有杀灭作用，但作用缓慢，一般要求60mg/m3，相对湿度≥70%，作用60-120分钟才能达到消毒效果。臭氧对人***，***规定大气中允许浓度为0.2mg/m3，故消毒必须在无人条件下进行。臭氧为强氧化剂，对多种物品有损坏，浓度越高对物品损坏越重，可使铜片出现绿色锈斑、橡胶老化，变色，弹性减低，以致变脆、断裂，使织物漂白褪色等。使用时应注意。
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巴氏灭菌还用于果酱、糖水水果罐头、啤酒、酸渍蔬菜类罐头、酱菜等的灭菌。巴氏灭菌对于密封的酸性食品具有可靠的耐酸性，对于那些不耐高湿处理的低酸性食品，只要不影响消费习惯，常利用加酸或借助于微生物发酵产酸的手段，使pH 值降至酸性食品的范围，可以利用低温灭菌达到保存食品品质和耐贮藏的目的。此法所需时间较长，对热敏性食品不宜采用。(2)高温短时灭菌(HTST)：灭菌条件为85 摄氏度～90 摄氏度/3 分钟～5 分钟，或95 摄氏度/12 分液料加热到接近100 摄氏度，然后速冷至室温。此方法需时较短，效果较好，有利于产品保质。主要可杀灭酵母菌、霉菌、乳酸菌等。这两种方法具有灭菌效果稳定，操作简单，设备***小，应用历史悠久等特点，如今还广泛用于各类罐藏食品、饮料、酒类、***、乳品包装的灭菌。
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