小型污水处理系统一般采用生物氧化工艺，包括接触氧化、生物流化床、炎时曝气、SBR和膜生物反应器(MBR)。SBR法属于间歇式活性污泥法，反应与沉淀同池完成，处理效率较低，而且需要专用的滗水装置，运行和管理自动化要求较高。MBR法是活性污泥与膜的组合，具有较高的处理效率，而且不需要二沉池;但是***较高和运行费用较高，膜组件污染重、能耗高，管理和维护相对繁杂。接触氧化和生物流化床在小型污水处理系统中较为多见，两者均属于生物膜法。生物膜法是在生化池中设置固定填料或流化填料，养殖废水处理，微生物附着其上形成的生物膜。
另外也可以采用污泥全回流的方式，使污泥中未完全转化的污染物充分氧化，进一步降低污泥产率。为了提高污水的可生化性，可以将生化池分成水解酸化池和好氧生化池运行。调节池出水进入水解酸化池，停留时间取16h大分子有机物水解为小分子有机物，可生化性得以提高。经水解酸化后的污水再进入好氧池曝气处理[6]。也有设计者尝试将二沉池污泥回流至水解酸化池而取消污泥池的工艺.
微电解技术是处理高浓度有机废水的一种理想工艺，该工艺用于高盐、难降解、高色度废水的处理不但能大幅度地降低cod和色度，还可大大提高废水的可生化性。该技术是在不通电的情况下，利用微电解设备中填充的微电解填料产生“原电池”效应对废水进行处理。当通水后，在设备内会形成无数的电位差达1.2V的“原电池”。“原电池”以废水做电解质，通过放电形成电流对废水进行电解氧化和还原处理，以达到降解有机污染物的目的。在处理过程中产生的新生态[·OH]、[H]、[O]、Fe2 、Fe3 等能与废水中的许多组分发生氧化还原反应，比如能***有色废水中的有色物质的发色基团或助色基团，甚至断链，万江养殖废水处理，达到降解脱色的作用；生成的Fe2 进一步氧化成Fe3 ，它们的水合物具有较强的吸附- 絮凝活性，石龙养殖废水处理，特别是在加碱调pH值后生成氢氧化亚铁和氢氧化铁胶体絮凝剂，它们的絮凝能力远远高于一般药剂水解得到的氢氧化铁胶体，能大量絮凝水体中分散的微小颗粒、金属粒子及有机大分子.其工作原理基于电化学、氧化-还原、物理以及絮凝沉淀的共同作用。该工艺具有适用范围广、处理效果好、成本低廉、处理时间短、操作维护方便、电力消耗低等优点，可广泛应用于工业废水的深度处理中。
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