生物菌肥不能与杀菌剂直接混用。喷施杀菌剂要间隔5-7天再施用生物菌肥，以免杀菌剂营***物菌肥的活性。生物菌肥配合发酵好的农家肥和复合肥效果更好。生物菌肥施用后可减少复合肥施用量，微生物菌剂有没有用，但生物菌肥不能取代复合肥，还需适量补充复合肥。农家肥有机质丰富，腐熟好与菌肥一起施用，可促进有机质分解，促进作物更好的吸收的养分。
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微生物肥料中的抗生菌在土壤中可迅速定殖，其所产生的素能有效***土壤中30余种常见土传病害，对作物生长有独特的防病保苗作用，同时可分泌大量的植物生长调节物质，可增产增收，提高作物品质，在重茬作物上使用可有效降低作物的连作障碍。常年使用可有效改良土壤结构及微生态环境。微生物肥料功能与作用：固氮菌在土壤中能够***进行固氮，具有较强的固氮能力，并且能够分泌生长素，促进植株的生长和果实的发育。
微生物在土壤中物质、能量的输入输出中扮演着非常重要的角色，能够活化土壤有机与无机养分，分解有机物，微生物菌剂，释放养分，微生物菌剂哪里有卖，增加养分的有效性；微生物通过代谢过程中氧气和二氧化碳的交换以及分泌的有机酸等酸性物质，促进土壤中微量元素的释放及螯合，有效打破土壤板结，促进团粒结构的形成，并能改善土壤的通气状况，促进有机质、腐殖酸和腐殖质的生成。
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