豆粕发酵中产生的益生菌和乳酸，一能***肠道中***菌的繁殖，二能促进动物消化，改善动物机能，可以减少仔猪等幼畜胃的发病率。微生物代谢产生蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶等各种消化酶，可促进豆粕中蛋白质和一些多糖类物质的降解，提高动物消化率。而且，大豆胚芽粉厂，微生物代谢物中还有对动物有直接营养作用的未知生长因子、***等，对促进营养物质消化，提高动物机能有积极意义。
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通过微生物发酵技术，可将豆粕中目前已知的胰蛋白酶***因子、大豆寡糖、大豆球蛋白、植酸、脲酶、非淀粉多糖(NSP) 等多种抗原进行降解，使这些抗营养因子含量降低或被完全消除。采用植物乳固态发酵豆粕，对豆粕中抗营养因子进行降解，结果表明，豆粕中尿素酶活性由原来的0.373 U/g 降低到0.166 U/g，延安大豆胚芽粉，胰蛋白酶含量由原来的40.42 mg/g 降低到18.01 mg/g。Hirabayashi 等使用宇佐美曲霉发酵大豆粕，大豆胚芽粉地址，发酵后植酸全部被降解。江永才的研究表明，发酵可使基料粗纤维含量降低12% ～ 16%。
蛋白酶的水解相对于酸碱法水解具有条件温和、无***物质残留等优点。在发酵豆粕中常用的蛋白酶制剂是中性蛋白酶及酸性蛋白酶，中性蛋白酶在家禽中的作用较好，大豆胚芽粉厂家生产，酸性蛋白酶在哺乳动物中作用较好。
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