肠衣属于食品范畴，用于灌制香肠供人类食用，所以出口肠衣加工企业必须遵守《出口食品厂、库卫生要求》和《出口肠衣加工企业注册卫生规范》之规定，使其加工卫生条件符合要求。加工采用的原料应来自安全非疫区，并经兽医宰前宰后检验健康无病的牲畜。
盐渍肠衣的加工程序一般是：取肠、去内容物、浸洗、刮制、再浸洗、灌l水分路、配量尺码、腌制沥水、缠绕肠把、成品包装、贮藏。用肠衣专用盐腌制的肠衣称为盐渍肠衣，如：盐渍猪肠衣、盐渍猪大肠头、盐渍猪肥肠、盐渍绵羊肠衣、盐渍山羊肠衣、盐渍牛小l肠和盐渍牛大肠等。即：肠从屠畜的腹腔取出后，使其与油脂分离，立即将肠的内容物捋净，用水冲净，将冲洗干净的原肠灌l水浸洗，使肠***松软，并及时刮制，去掉粘膜层、肌层、浆膜层，保留粘膜下层(即肠衣)，然后，根据标准的规定或合同的要求，灌l水分路，这个工序是整个成品加工过程中的一个重要环节，不仅要准确的确定口径的大小，同时要注意检查肠衣的内在质量，使其达到符合出口规格质量标准要求
市民选择肠衣时，应先灌l水观察，天然肠衣表面会现出明显的血管经络;人造肠衣则十分光滑，没有痕迹。捞出来后再放入一些面碱，就是食用的碱，再返复的搓洗，再用温水清洗几遍捞出就大功告成了。而且，除了一种胶原蛋白肠衣，其他的人造肠衣一般都不能食用。即便是可食用的胶原蛋白肠衣，添加剂也容易造成安全隐患。例如添加甘油、添加保鲜剂，采用一些增加口感、抗高温等的新工艺。这些工艺累计起来是否安全，也应该引起管理部门的高度重视。想做好香肠当然离不开肠衣，市面上不可能买到处理好的肠衣，所以有必要亲手来做。
高品质的肠衣对香肠而言应达到以下几点要求：
（1）好的氧气、水汽及香味阻隔性；
（2）好的物理机械性能以满足灌肠工艺的要求；
（3）好的肉粘性能防止水份及肉汁从肉中溢出；
（4）安全可靠的食品卫生性；
（5）耐蒸煮性能满足香肠杀菌工艺的要求；
（6）肠衣表面光亮度及印刷效果；
（7）好的规格性能价格比。
肠衣作为香肠的外包装，其基本的功能就是保证香肠在一定条件及时间内不变质，以满足贮存及流通的需要。这种功能由肠衣的阻隔性指标所提供的，即：氧气阻隔性、水汽阻隔性、香味阻隔性。
