影响秸秆粉碎机粉碎效果的因素主要有：锤片数目、锤片间隙、锤片厚度、筛孔直径、加工原料的水分含量和种类等多种因素。当锤片等工作部件损坏需要调整和更换时，必须按“使用说明书”的要求，分组对称安装排列，不得搞错。如果转子不平衡，不但影响生产效率，还将加剧机器的振动。传统粉碎后风运系统的风道方向安装均与粉碎机转子旋转切向方向相同。
若加工豆饼等较大物料时，须先用刀或锤将其加工成边长小于4cm的小块；地瓜藤、花生秧等要先用铡刀切成长度小于15cm的碎段，以防因喂入不均而造成超负荷工作。在安装粉碎机吸风系统（尤其是气力输送系统）时，均没有注意吸风系统安装位置会影响粉碎粒度（尤其是水产饲料），而且传统粉碎后风运系统的风道方向安装均与粉碎机转子旋转切向方向相同。
粉碎机的研制在国内已有几十年的历史，其主要集中在饲料粉碎和农作物秸秆切碎等方面。粉碎技术根据粉碎方式和粉碎手段的不同可分为铡切式、锤片式、揉切式和组合式粉碎技术。秸秆粉碎机堵塞是秸秆粉碎机使用中常见的故障之一，可能有设备配套设计上存在的问题，但更多是由于使用操作不当造成的。进料速度过快，负荷过大，造成堵塞。
