柔性版印刷和凸版印刷在印刷原理上都属于凸版印刷方式，为便于理解和区分，习惯上人们将使用液体油墨、柔软印版的印刷方式称为柔性版印刷；而将传统上使用膏状油墨、硬质印版的的印刷方式称为凸版印刷。两者在印刷油墨的使用，印刷着墨原理，固态版柔印制版，输墨系统的选择以及油墨使用量上都有不小的区别，在印版的厚度和硬度上以用制作方面也有很大的不同。
柔性版印刷使用液体油墨，不需要复杂的输墨系统，只需一只墨斗辊将油墨传递给网纹棍或将网纹棍直接同油墨接触(凹印输墨方式)，柔印制版，网纹棍表面的油墨然后被刮墨刀去掉、油墨保存在网穴里，这种传墨方式称为短墨路系统。短墨路系统机构简单、调整方便、材料消耗低，是柔版印刷的显著特点。
而凸版印刷为使膏状油墨均匀地转移到印版上，凸版印刷机上有复杂的输墨系统，包括;墨斗、墨斗辊、传墨辊、传墨辊、串墨辊、着墨辊等，称为长墨路系统。只有通过长墨路系统，液态版柔印制版，膏状油墨才能形成均匀的墨层。
柔性版印刷要根据原稿和客户要求，选定合适的印刷色数、色序、幅面及相应的版辊（齿数、网线数等）。
柔性版印刷的原稿有许多是由胶印转过来的，这两种印刷工艺之间有着很大的区别，因此不能够照抄照搬胶印的工艺（尤其是分色制版工艺），要根据柔性版印刷工艺自身的特点，结合该公司柔版印刷机的性能来处理原稿，并同客户协调好。
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